使用 GUIbiont 进行无代码微生物生长表型分析

root 提交于 周三, 08/19/2026 - 20:47
微生物生长筛选会产生数千条生长曲线,但跨实验比较以及将生长表型映射到基因型或环境,通常都需要定制代码。GUIbiont 是一款无需编程的浏览器应用程序,用于开展质量控制、曲线拟合、聚类以及结合元数据并采用机器学习技术的分析。交互式会话可导出为 Julia 脚本,使用户能够复现或扩展基于浏览器的分析。 在对 3,885 株大肠杆菌缺失菌株和 13,608 条限定培养基条件下的生长曲线进行验证时,GUIbiont 成功识别出已知的营养缺陷型和营养依赖性表型。

微生物生长筛选会产生数千条生长曲线,但跨实验比较以及将生长表型映射到基因型或环境,通常都需要编写定制代码。GUIbiont 是一种无需编程的浏览器应用程序,用于开展质量控制、曲线拟合、聚类以及结合元数据的机器学习分析。

交互式会话可导出为 Julia 脚本,使用户能够复现或扩展在浏览器中的分析。通过对 3,885 个大肠杆菌缺失菌株和 13,608 条限定培养基生长曲线的验证,GUIbiont 成功重现了已知的营养缺陷型和营养依赖性表型。


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.17.745250v1?rss=1

🏷️ 微生物生长表型 无代码分析 生长曲线拟合 机器学习 大肠杆菌