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白细胞介素-13（IL-13）是一种具有免疫调节作用的细胞信号传导细胞因子，已被认为与神经退行性疾病和慢性炎症有关。IL-13分别与其低亲和力和高亲和力受体——白细胞介素-13受体1（IL-13R1）和白细胞介素-13受体2（IL-13R2）结合，其驻留时间也相应不同。鉴于细胞因子-受体复合物的结合动力学会影响细胞响应，我们采用基于分子动力学（MD）模拟的{tau}-随机加速分子动力学方法（{tau}RAMD），计算了野生型（WT）IL-13及19种IL-13突变体与这两种受体结合的相对驻留时间。与实验动力学数据的比较表明，{tau}RAMD计算能够捕捉驻留时间的变化趋势。对细胞因子-受体复合物模拟解离轨迹的分析揭示了IL-13从每种受体解离的两条不同途径。因此，本研究明确了IL-13与其受体相互作用的关键决定因素，这些因素可作为治疗设计的靶点。
白细胞介素-13与其低亲和力和高亲和力受体复合物驻留时间及解离机制的决定因素 | bioRxiv
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白细胞介素-13与其低亲和力和高亲和力受体复合物驻留时间及解离机制的决定因素
Nico Herb， Mislav Brajkovic， Giulia D'Arrigo， Daria B Kokh， Rebecca C. Wade
doi： https://doi.org/10.64898/2026.08.13.743369
Nico Herb 1 海德堡理论研究所；
Mislav Brajkovic 1 海德堡理论研究所；
Giulia D'Arrigo 1 海德堡理论研究所；
Giulia D'Arrigo 的 ORCID 记录
Daria B Kokh 1 海德堡理论研究所；
Daria B Kokh 的 ORCID 记录
Rebecca C. Wade 2 海德堡理论研究所（HITS）
Rebecca C. Wade 的 ORCID 记录
通讯作者： rebecca.wade{at}h-its.org
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摘要
白细胞介素-13（IL-13）是一种具有免疫调节作用的细胞信号细胞因子，已被认为与神经退行性疾病和慢性炎症有关。IL-13分别与其低亲和力受体IL-13受体α1（IL-13Rα1）和高亲和力受体IL-13受体α2（IL-13Rα2）结合，其驻留时间也相应不同。鉴于细胞因子-受体复合物的结合动力学会影响细胞响应，我们采用基于分子动力学（MD）模拟的τ-随机加速分子动力学方法（τRAMD），计算野生型（WT）IL-13及19种IL-13突变体与这两种受体结合时的相对驻留时间。与实验动力学数据的比较表明，τRAMD计算能够捕捉驻留时间的变化趋势。对细胞因子-受体复合物模拟解离轨迹的分析揭示了IL-13从每一种受体解离的两条不同途径。因此，持有人为作者/资助方，其已授予bioRxiv永久展示该预印本的许可。 本文依据CC-BY-ND 4.0国际许可协议公开提供。
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发布于2026年8月18日。
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白细胞介素-13与其低亲和力和高亲和力受体复合物驻留时间及解离机制的决定因素
Nico Herb， Mislav Brajkovic， Giulia D'Arrigo， Daria B Kokh， Rebecca C. Wade
bioRxiv 2026.08.13.743369； doi： https://doi.org/10.64898/2026.08.13.743369
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白细胞介素-13与其低亲和力和高亲和力受体复合物驻留时间及解离机制的决定因素
Nico Herb， Mislav Brajkovic， Giulia D'Arrigo， Daria B Kokh， Rebecca C. Wade
bioRxiv 2026.08.13.743369； doi： https://doi.org/10.64898/2026.08.13.743369
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.13.743369v1?rss=1
🏷️ 白细胞介素-13 细胞因子受体 分子动力学模拟 驻留时间 解离机制