VEZF1通过调控发育转录程序和CTCF占位促进多能性退出

血管内皮锌指蛋白1（VEZF1）对胚胎发育至关重要，但其在多能性退出过程中的作用仍不清楚。先前研究表明，Vezf1缺失的胚胎干细胞（ESC）表现出分化受损、Dnmt3b表达降低以及全基因组范围低甲基化。在本研究中，我们表明，Vezf1-/- ESC在分化过程中无法有效抑制多能性转录程序，且这一缺陷在异位表达Dnmt3b后仍然持续存在。全基因组分析显示，VEZF1占据了参与多种发育信号通路基因的调控区域，包括MAPK、WNT和Hippo通路，以及部分与多能性相关的基因。许多被VEZF1结合的MAPK基因在未分化的Vezf1-/- ESC中表现出表达降低，提示VEZF1活性有助于建立高效退出多能性所必需的转录能力。VEZF1缺失还导致了与发育信号传导相关的新CTCF位点的大范围获得，其中一部分与VEZF1结合的调控区域发生重叠。CTCF耗竭对所检测的VEZF1结合MAPK基因表达仅产生有限影响，表明仅凭CTCF占据增加并不足以解释Vezf1-/- ESC中这些基因表达降低的现象。综上所述，我们的研究揭示了VEZF1在促进多能性退出和建立分化所需转录能力方面具有一种不依赖于DNMT3B的功能，同时提示VEZF1在发育状态转换过程中调控CTCF占据方面可能发挥作用。

血管内皮锌指蛋白1（VEZF1）对胚胎发育至关重要，但其在多能性退出过程中的作用仍不清楚。既往研究表明，Vezf1缺失的胚胎干细胞（ESC）表现出分化受损、Dnmt3b表达降低以及全基因组低甲基化。在本研究中，我们表明，Vezf1-/- ESC在分化过程中无法有效抑制多能性转录程序，且这一缺陷在异位表达Dnmt3b后仍然持续存在。全基因组分析显示，VEZF1占据了多个发育信号通路相关基因的调控区域，包括MAPK、WNT和Hippo通路，以及部分多能性相关基因。许多受VEZF1结合的MAPK基因在未分化的Vezf1-/- ESC中表达降低，提示VEZF1活性有助于建立高效退出多能性所必需的转录能力。VEZF1缺失还导致与发育信号相关的大范围新生CTCF位点获得，其中一部分与VEZF1结合的调控区域重叠。CTCF耗竭对所检测的受VEZF1结合的MAPK基因表达仅产生有限影响，这表明单独增加CTCF占据不足以解释这些基因在Vezf1-/- ESC中表达降低的现象。综上，我们的研究揭示了VEZF1在促进多能性退出和建立分化所需转录能力方面具有一种不依赖于DNMT3B的功能，同时提示VEZF1在发育状态转换过程中调控CTCF占据方面可能发挥作用。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.13.744713v1?rss=1

🏷️ VEZF1 多能性退出 胚胎干细胞 发育转录调控 CTCF占位 MAPK信号通路