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子痫前期（PE）是一种妊娠特异性的高血压性疾病，也是导致孕产妇和胎儿死亡的主要原因之一。PE胎盘及母体血浆的一个共同特征是血脂异常，即脂质水平异常，这会增加氧化应激和内皮功能障碍。然而，导致这些异常的精确转录、转录后及表观遗传机制仍缺乏充分表征。识别此类变化有助于阐明疾病机制，并发现与脂质相关的PE生物标志物。 我们开展了一项大规模Meta分析，整合了来自NCBI GEO的公开胎盘数据集，包括4个DNA甲基化（DNAm）数据集（n = 172）、3个RNA测序数据集（n = 92）以及一个独立的RNA微阵列验证队列（n = 146）。我们评估了PE胎盘与对照胎盘之间的差异DNAm（limma）、基因表达（DESeq2）、转录本水平变化（Swish）以及可变剪接（rMATS），并通过交互项模型按胎儿性别进行分层分析。我们还进行了胎盘细胞类型去卷积，以定量评估与PE相关的细胞类型比例变化。 结果表明，PE胎盘中与脂质相关的调控变化主要发生在基因和转录本水平，而DNAm未显示出变化。我们还鉴定出PE中显著的亚型转换，而这些变化未能通过差异基因表达分析检测到，并且其主要由可变转录起始位点和终止位点驱动，而非可变剪接。其中一部分亚型转换定位于PE中失调的通路，并被预测会引起功能性蛋白改变。交互项模型鉴定出若干PE中的性别特异性差异表达基因（DEGs），其中包括一部分雄性胎儿特异性下调、参与氧化代谢的基因。然而，其余许多在两性中发现的性别特异性DEGs此前在文献中尚未得到表征。这些发现提示，转录及亚型水平的调控在PE相关血脂异常中发挥作用，且某些调控通路呈现胎儿性别特异性模式。
子痫前期（PE）是一种妊娠特异性的高血压性疾病，也是孕产妇和胎儿死亡的主要原因之一。PE胎盘和母体血浆的一个共同特征是血脂异常，即脂质水平异常，这会加剧氧化应激和内皮功能障碍。然而，导致这些异常的精确转录、转录后及表观遗传机制目前仍缺乏充分表征。识别这些变化有助于阐明疾病机制，并发现与脂质相关的PE生物标志物。
我们开展了一项大规模荟萃分析，整合了来自NCBI GEO的公开胎盘数据集，包括4个DNA甲基化（DNAm）数据集（n = 172）、3个RNA测序数据集（n = 92）以及一个独立的RNA微阵列验证队列（n = 146）。我们评估了PE胎盘与对照胎盘之间的差异DNAm（limma）、基因表达（DESeq2）、转录本水平变化（Swish）和可变剪接（rMATS），所有分析均通过交互项模型按胎儿性别分层进行。我们还进行了胎盘细胞类型去卷积分析，以定量评估与PE相关的细胞类型比例变化。
结果表明，PE胎盘中与脂质相关的调控变化主要发生在基因和转录本水平，而DNAm未显示出变化。我们还鉴定出PE中显著的异构体转换，而这些变化未被差异基因表达分析检测到，并且其主要驱动因素是可变转录起始位点和终止位点，而非可变剪接。其中一部分异构体转换定位于PE中失调的通路，并被预测会引起蛋白功能改变。交互项模型还识别出若干PE中的性别特异性差异表达基因（DEGs），其中包括一部分雄性胎儿特异性下调的、参与氧化代谢的基因。然而，其余许多在两性中观察到的性别特异性DEGs，此前在文献中尚未得到表征。
这些发现表明，转录水平和异构体水平的调控在PE相关血脂异常中发挥作用，且某些调控通路呈现出胎儿性别特异性的模式。
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.17.745256v1?rss=1
🏷️ 子痫前期 胎盘转录调控 脂质代谢异常 转录本异构体 可变转录起始终止 胎儿性别差异