基于全基因组重测序的比较变异分析鉴定出与惠阳胡须鸡交喙表型相关的候选基因

交叉喙被认为对家禽健康、生产性能和动物福利构成威胁。然而，由于该表型呈散发性发生、基因位点具有异质性且表现为不完全显性，交叉喙形成的分子机制，尤其是交叉程度的形成机制，尚不清楚。因此，我们基于全基因组重测序的变异分析，通过比较惠阳胡须鸡不同畸形程度的表型，筛选关键基因并揭示交叉喙可能的表型形成机制。 交叉喙鸡与正常喙鸡之间的比较分析鉴定出多个候选基因中的差异变异，包括 CDH11、CTNNAL1、NRXN3、NRXN1、CDH5、SDC3 和 DHFR。携带这些变异的基因富集于与细胞黏附分子和代谢过程相关的通路中，其功能注释涉及细胞间黏附和神经嵴细胞迁移。重度与轻度交叉喙畸形鸡之间的比较分析进一步鉴定出其他候选基因，包括 MRPL21、NSUN2、DDX55、GNB3 和 NFKB2。这些基因与黏着斑、肌萎缩侧索硬化、类固醇 7-羟化酶活性以及皮肤屏障建立相关的富集条目和通路有关。 这些发现为今后开展鸡交叉喙发生及其严重程度的功能研究提供了初步的遗传变异目录和候选基因资源。

交叉喙被认为是对家禽健康、生产性能和动物福利的威胁。然而，由于病例具有散发性、基因位点存在异质性且表现为不完全显性，交叉喙形成的分子机制，尤其是交叉程度的形成机制，迄今仍不明确。因此，我们基于全基因组重测序的变异分析，通过比较惠阳胡须鸡不同畸形程度的个体，筛选关键基因并揭示交叉喙可能的表型形成机制。

交叉喙鸡与正常喙鸡之间的比较分析鉴定出多个候选基因中的差异变异，包括CDH11、CTNNAL1、NRXN3、NRXN1、CDH5、SDC3和DHFR。携带这些变异的基因富集于与细胞黏附分子和代谢过程相关的通路，其功能注释涉及细胞间黏附和神经嵴细胞迁移。严重交叉喙与轻度交叉喙鸡之间的比较分析进一步鉴定出其他候选基因，包括MRPL21、NSUN2、DDX55、GNB3和NFKB2。这些基因与黏着斑、肌萎缩侧索硬化、类固醇7-羟化酶活性及皮肤屏障建立相关的富集条目和通路有关。

这些发现为今后开展鸡交叉喙发生及其严重程度的功能研究提供了初步的遗传变异目录和候选基因资源。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.11.744104v1?rss=1

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