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滤泡性淋巴瘤（FL）活检样本的组织学检查仍然是FL诊断分级的基石。单细胞测序方法虽然具有丰富的转录组信息，但需要对组织进行解离，并且会丢失支撑FL向弥漫大B细胞淋巴瘤（DLBCL）转化的天然空间背景。为研究不同疾病状态下恶性B细胞与肿瘤微环境（TME）之间的空间相互作用，我们对12对转化前/转化后配对样本以及10例未发生转化的FL对照样本进行了亚细胞单细胞空间转录组学和空间蛋白质组学分析，并结合匹配的单细胞全基因组测序（scWGS）数据进行整合分析。 我们的分析表明，FL转化伴随着向以B细胞占优势的基质性及免疫抑制性细胞邻域的转变，且这种扩增的幅度与转化发生时间相关。在转化发生之前，具有免疫调节作用的Galectin-9相互作用会从滤泡内核心区域迁移至滤泡外空间。与scWGS数据整合后进一步显示，恶性B细胞中较高的拷贝数不稳定性与支持性T细胞生态位的减少以及转化状态下增强的免疫调节性交互作用相关。总体而言，我们的多组学分析刻画了FL转化过程中TME的重塑，为完善疾病演化模型提供了依据。
转化性滤泡性淋巴瘤中肿瘤微环境的单细胞空间多组学表征 | bioRxiv
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转化性滤泡性淋巴瘤中肿瘤微环境的单细胞空间多组学表征
查看 ORCID 个人资料 Shaocheng Wu， Eric Lee， Anne-Sophie Fratzscher， Andrew Lytle， Spencer D Martin， Tina Hsu， Adele Telenius， Yifan Yin， Amos Fong， Shinya Rai， Manuba Fujisawa， Honor Cheung， Samuel Aparicio， David G Huntsman， Tomohiro Aoki， David W Scott， Christian Steidl， 查看 ORCID 个人资料 Andrew Roth
doi： https://doi.org/10.64898/2026.08.11.743383
Shaocheng Wu 1 斯坦福大学； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本网站上搜索该作者 Shaocheng Wu 的 ORCID 记录
Eric Lee 2 英属哥伦比亚大学； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本网站上搜索该作者
Anne-Sophie Fratzscher 3 BC Cancer； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本网站上搜索该作者
Andrew Lytle 2 英属哥伦比亚大学； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本网站上搜索该作者
Spencer D Martin 2 英属哥伦比亚大学； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本网站上搜索该作者
Tina Hsu 3 BC Cancer； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本网站上搜索该作者
Adele Telenius 3 BC Cancer； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本网站上搜索该作者
Yifan Yin 3 BC Cancer； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本网站上搜索该作者
Amos Fong 3 BC Cancer； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本网站上搜索该作者
Shinya Rai 3 BC Cancer； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本网站上搜索该作者
Manuba Fujisawa 3 BC Cancer； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本网站上搜索该作者
Honor Cheung 2 英属哥伦比亚大学； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本网站上搜索该作者
Samuel Aparicio 3 BC Cancer； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本网站上搜索该作者
David G Huntsman 3 BC Cancer； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本网站上搜索该作者
Tomohiro Aoki 4 玛格丽特公主癌症中心 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本网站上搜索该作者
David W Scott 3 BC Cancer； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本网站上搜索该作者
Christian Steidl 3 BC Cancer； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本网站上搜索该作者
Andrew Roth 3 BC Cancer； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在本网站上搜索该作者 Andrew Roth 的 ORCID 记录
通讯作者： aroth{at}bccrc.ca
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摘要
滤泡性淋巴瘤（FL）活检的组织学检查仍然是 FL 诊断分级的基石。单细胞测序方法虽然具有丰富的转录组信息，但需要进行组织解离，并会丢失构成 FL 向弥漫大 B 细胞淋巴瘤（DLBCL）转化基础的原位空间背景。为研究不同疾病状态下恶性 B 细胞与肿瘤微环境（TME）之间的空间相互作用，我们对 12 对转化前/转化后配对样本和 10 例未转化 FL 对照样本进行了亚细胞分辨率的单细胞空间转录组学和空间蛋白质组学分析，并与匹配的单细胞全基因组测序（scWGS）数据进行整合。我们的分析显示，转化伴随着向以 B 细胞为主的基质性和免疫抑制性细胞邻域的转变，且其扩张程度与转化所需时间相关。在转化发生之前，免疫调节性 Galectin-9 相互作用从滤泡内核心区域转移至滤泡外空间。与 scWGS 的整合分析表明，恶性 B 细胞中较高的拷贝数不稳定性与支持性 T 细胞生态位的减少以及转化状态下增强的免疫调控性交叉通讯相关。总体而言，我们的多组学分析刻画了 FL 转化过程中 TME 的重塑，并有助于完善疾病演化模型。
利益冲突声明
已声明资助信息
加拿大自然科学与工程研究委员会 RGPIN-202204378
特里·福克斯研究所 1108
版权
本预印本的。 本文依据 CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可协议 公开提供。
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发布于 2026 年 8 月 15 日。
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Shaocheng Wu， Eric Lee， Anne-Sophie Fratzscher， Andrew Lytle， Spencer D Martin， Tina Hsu， Adele Telenius， Yifan Yin， Amos Fong， Shinya Rai， Manuba Fujisawa， Honor Cheung， Samuel Aparicio， David G Huntsman， Tomohiro Aoki， David W Scott， Christian Steidl， Andrew Roth
bioRxiv 2026.08.11.743383； doi： https://doi.org/10.64898/2026.08.11.743383
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转化性滤泡性淋巴瘤中肿瘤微环境的单细胞空间多组学表征
Shaocheng Wu， Eric Lee， Anne-Sophie Fratzscher， Andrew Lytle， Spencer D Martin， Tina Hsu， Adele Telenius， Yifan Yin， Amos Fong， Shinya Rai， Manuba Fujisawa， Honor Cheung， Samuel Aparicio， David G Huntsman， Tomohiro Aoki， David W Scott， Christian Steidl， Andrew Roth
bioRxiv 2026.08.11.743383； doi： https://doi.org/10.64898/2026.08.11.743383
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.11.743383v1?rss=1
🏷️ 滤泡性淋巴瘤 肿瘤微环境 单细胞空间多组学 空间转录组学 免疫抑制 拷贝数不稳定性