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理解物种在地理背景下的演化历史是历史生物地理学的关键，因为它揭示了地质与气候变化如何塑造生物多样性。这一点在亚马逊和奥里诺科流域等具有重要生态意义的区域尤为重要。二者共同拥有全球最丰富的淡水鱼多样性（约 3,500 个物种），并共享一段共同但尚未完全阐明的演化历史。金带鲶（Brachyplatystoma rousseauxii）是一种古老物种，在新热带区以元种群形式广泛分布，是研究这两个流域之间过去连通性、分化及塑造鱼类多样性的历史过程的重要模式物种。本研究利用核基因组（微卫星和 ddRADseq）及线粒体 DNA，分析了 B. rousseauxii 的遗传结构、连通路径和种群历史。种群结构分析与共祖模型表明，奥里诺科和亚马逊流域的 B. rousseauxii 种群在遗传上彼此分化，且没有当前基因流动的证据。然而，我们的结果支持在分化之后可能发生过二次接触事件，Boa Vista 种群保留了这一过程的遗传信号。祖先种群的分裂发生在 Rupununi Portal 约 2.54 Ma（ddRAD）或 1.31 Ma（mtDNA）。随后，该物种约在 1.90 Ma（ddRAD）或 0.6 Ma（mtDNA）定殖 Branco 和奥里诺科河，并在奥里诺科迅速扩张（>1.3 Ma 或 >0.29 Ma），而从 Branco 河向亚马逊的定殖则更为近期（≤1.0 Ma 或 ≤0.15 Ma）。在奥里诺科检测到种群扩张信号（约 0.20 Ma），而亚马逊种群保持稳定。我们的研究结果表明，晚中新世 Vaupes Arch 的抬升并不能解释所观察到的遗传分化。同样，Casiquiare 运河和 Japura-Guaviare 源头区也不是两个流域之间的连通通道。相反，Rupununi Portal，包括 Branco 河被 Negro 河近期夺河事件在内，是最后的连通点，并在塑造 B. rousseauxii 的分布格局中发挥了关键作用。这些发现为理解新热带鱼类生物地理学以及奥里诺科和亚马逊流域的历史构型提供了新的认识。
从地理背景下理解物种的演化历史是历史生物地理学的关键，因为这揭示了地质和气候变化如何塑造生物多样性。这一点在亚马逊和奥里诺科流域等具有重要生态意义的地区尤为重要。两者共同拥有世界上最丰富的淡水鱼多样性（约3500种），并共享一段共同但尚未完全阐明的演化历史。金装鲶（Brachyplatystoma rousseauxii）是一种古老物种，在新热带界以元种群形式广泛分布，是研究这两个流域之间过去连通性、分化及塑造鱼类多样性的历史过程的重要模式物种。本研究利用核基因（微卫星和ddRADseq）及线粒体DNA分析了B. rousseauxii的遗传结构、连通路径和种群历史。种群结构分析和共祖模型表明，来自奥里诺科和亚马逊流域的B. rousseauxii种群在遗传上彼此分化，且没有当前基因流的证据。然而，我们的结果支持在分化之后可能发生过一次二次接触事件，且Boa Vista种群保留了这一过程的遗传信号。祖先种群在Rupununi Portal处分裂，时间约为2.54 Ma（ddRAD）或1.31 Ma（mtDNA）。随后，该物种约于1.90 Ma（ddRAD）或0.6 Ma（mtDNA）定殖Branco河和奥里诺科河，并在奥里诺科迅速扩张（>1.3 Ma或>0.29 Ma），而其从Branco河向亚马逊的定殖则更晚（≤1.0 Ma或≤0.15 Ma）。在奥里诺科检测到种群扩张信号（约0.20 Ma），而亚马逊种群保持稳定。我们的研究结果表明，晚中新世Vaupes Arch的抬升不能解释所观察到的遗传分化。同样，Casiquiare Canal和Japura-Guaviare源头也不是流域间的连通通道。相反，Rupununi Portal，包括Branco河被Negro河近期夺获，才是最后的连接点，并在塑造B. rousseauxii的分布中发挥了关键作用。这些发现为新热带鱼类生物地理学以及奥里诺科和亚马逊流域的历史格局提供了新的认识。
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.04.742678v1?rss=1
🏷️ 历史生物地理 种群遗传结构 洪堡式连通通道 亚马孙河流域 奥里诺科河流域 微卫星与ddRADseq