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引言:肠道微生物群易受外源化学物质(xenobiotics)的影响,这些物质包括药物、环境污染物以及膳食污染物,如黄曲霉毒素B1(AFB1)和伏马菌素B1(FB1)。在实验室中评估这些外源化学物质的作用,通常需要将其溶解于溶剂载体中,如二甲基亚砜(DMSO)。尽管DMSO通常以低浓度使用,并被假定为中性,但其对微生物动态的独立影响可能构成实验混杂因素,而这一问题尚未得到充分探究。 方法:将人体粪便微生物群在体外培养16天,并补充添加0、10、100和1000 ppb的受试外源化学物质(AFB1或FB1),均以0.05% DMSO(v/v)为载体,同时设置无DMSO对照组进行比较。通过全长16S rRNA基因测序表征微生物群落动态,并通过测定短链脂肪酸和气体的产生来评估代谢活性。 结果:DMSO显著改变了微生物代谢,并驱动了脱硫弧菌(Desulfovibrio desulfuricans)的持续富集。这一变化在所有AFB1和FB1处理组中均出现,且与其浓度无关,表明DMSO载体的生物学影响掩盖了外源化学物质本身的特异性效应。 讨论:这些发现表明,DMSO可独立于所研究的外源化学物质而诱导显著的微生物群变化,从而可能混淆生物学解释。这凸显了在微生物群研究中对溶剂载体进行严格验证并确定其安全使用阈值的关键必要性。
引言:肠道微生物群易受外源化学物质(xenobiotics)的影响,包括药物、环境污染物以及黄曲霉毒素B1(AFB1)和伏马毒素B1(FB1)等膳食污染物。在实验室中评估这些外源化学物质的作用,需要先将其溶解于溶剂载体中,例如二甲基亚砜(DMSO)。尽管DMSO通常以低浓度使用,并被假定为中性,但其对微生物动态的独立影响可能成为实验中的混杂因素,而这一点尚未得到充分探讨。
方法:将人体粪便微生物群在体外培养16天,分别补充含有0、10、100和1000 ppb待测外源化学物质(AFB1或FB1)的0.05% DMSO(v/v),并设置无DMSO对照组进行比较。通过全长16S rRNA基因测序表征微生物群落动态,并通过测定短链脂肪酸和气体的产生来评估代谢活性。
结果:DMSO显著改变了微生物代谢,并驱动脱硫弧菌(Desulfovibrio desulfuricans)的持续富集。这种变化在所有AFB1和FB1处理组中均出现,且与其浓度无关,表明DMSO载体的生物学影响掩盖了外源化学物质本身的特异性效应。
讨论:这些发现表明,DMSO可独立于所研究的外源化学物质而诱导显著的微生物变化,从而可能干扰生物学解释。这凸显了在微生物群研究中对溶剂载体进行严格验证并确定其安全阈值的关键必要性。
📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.12.743806v1?rss=1
🏷️ 肠道微生物群 二甲基亚砜 外源化合物 16S rRNA测序 短链脂肪酸 脱硫弧菌
来源出处
重新审视二甲基亚砜在外源化合物—肠道微生物群相互作用研究中的应用
https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.12.743806v1?rss=1