涵盖健康与疾病状态的人类肾脏综合图谱

人类肾脏包含高度特化的细胞群体。尽管已有大量单细胞和单核转录组学研究，但由于队列、技术、分析流程和注释框架之间存在差异，限制了对一致性肾脏细胞状态的界定、疾病相关细胞群体的识别以及对肾脏疾病遗传易感性的解释能力。在此，我们整合了18个人类肾脏单细胞和单核RNA测序数据集，这些数据涵盖232名供体和5种主要疾病背景，并通过统一处理和计算整合构建了人类肾脏细胞图谱（Human Kidney Cell Atlas, HKCA），其中包含超过100万个高质量细胞（816,895个）和细胞核（215,308个）。HKCA解析出63种细胞类型和120种协调统一的细胞状态，其中包括与肾脏疾病相关的稀有上皮和基质细胞群体。结合空间转录组学、细胞间通信网络以及人类遗传关联数据，进一步界定了这些细胞群体的解剖学背景及其疾病相关性。HKCA还为独立的人类和小鼠肾脏数据集的自动化注释提供了框架。总体而言，HKCA建立了一个关于人类肾脏生物学的综合性参考图谱，能够在细胞分辨率水平上促进疾病解释和遗传风险定位。

人类肾脏包含高度特化的细胞群体。尽管已经开展了大量单细胞和单核转录组学研究，但由于队列、技术、分析流程和注释框架存在差异，限定了界定一致性肾脏细胞状态、识别疾病相关细胞群体以及解释肾脏疾病遗传易感性的能力。在本研究中，我们整合了18个人类肾脏单细胞和单核RNA测序数据集，这些数据集涵盖232名供体和5种主要疾病背景，并将其经过统一处理和计算整合，构建成人类肾脏细胞图谱（Human Kidney Cell Atlas, HKCA），其中包括超过100万个高质量细胞（816,895个）和细胞核（215,308个）。HKCA解析了63种细胞类型和120种协调统一的细胞状态，其中包括与肾脏疾病相关的稀有上皮和基质细胞群体。通过与空间转录组学、细胞间通信网络以及人类遗传关联数据相整合，进一步界定了这些细胞群体的解剖学背景及其疾病相关性。HKCA还为独立的人类和小鼠肾脏数据集的自动化注释提供了框架。总体而言，HKCA建立了一个全面的人类肾脏生物学参考图谱，能够在细胞分辨率水平上促进疾病解释和遗传风险定位。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.12.744548v1?rss=1

🏷️ 肾脏单细胞图谱 单细胞RNA测序 空间转录组学 细胞状态解析 肾脏疾病 遗传风险定位