雅温得两家医疗机构临床样本中多重耐药大肠杆菌中质粒介导的喹诺酮和ESBL耐药基因高发生率

root 提交于 周六, 08/15/2026 - 00:47
引言 在撒哈拉以南非洲,尤其是在喀麦隆,抗微生物耐药性(AMR)构成了重大的公共卫生威胁。多重耐药细菌日益增多的出现凸显了这一问题。产超广谱β-内酰胺酶的大肠埃希菌(ESBL-Ec)作为一种关键优先级病原菌,正日益被证实与喀麦隆医院及社区环境中的危及生命感染相关。关于喀麦隆环丙沙星耐药大肠埃希菌遗传组成的数据仍然有限。本研究旨在调查喀麦隆雅温得两所医院临床样本中分离的多重耐药大肠埃希菌的流行率、遗传多样性及耐药机制。 方法 2025年2月至6月,在喀麦隆雅温得两家医疗机构开展了一项横断面研究。对住院和门诊患者的所有临床样本进行了分析。培养后,按照制造商说明使用API20E进行鉴定,并在CHROMagarTM ESBL上筛查ESBL产生。采用Kirby-Bauer纸片扩散法进行抗菌药物敏感性试验。采用聚合酶链反应(PCR)检测ESBL和质粒介导喹诺酮耐药(PMQR)基因,以及喹诺酮耐药决定区(QRDR)(gyrA/parC)中的突变。同时还研究了水平质粒转移。最后,进行了系统发育群分析。 结果 多重耐药大肠埃希菌的流行率为50.7%(n=33/65),其中全部(100%)均为ESBL产生菌,91%对环丙沙星耐药。对头孢噻肟(100%)、头孢曲松(100%)和环丙沙星(91%)的耐药率最高。最常见的ESBL基因为blaTEM(36.3%;n=12/33)。在PMQR基因中,qnrB在16.6%(n=5/30)的分离株中被检出。仅ESBL基因由质粒携带;最常见的质粒携带基因为blaTEM(40%),其次为blaCTX-M(26.7%)。在拓扑异构酶QRDR(parC基因)内的突变见于36.6%(n=11/30)的环丙沙星耐药菌株。系统发育群分析显示,以A群为主,其次为B群。 结论 本研究揭示了雅温得大肠埃希菌中多重耐药、ESBL(以blaTEM为主)及氟喹诺酮耐药的高流行率,并发现ESBL基因的质粒传播以及PMQR决定子在染色体上的稳定化。临床样本中共生菌系统发育群的占优势,强调了社区储存库的作用。亟需在喀麦隆加强“实时One Health”基因组监测。

引言 在撒哈拉以南非洲,尤其是在喀麦隆,抗微生物耐药性(AMR)构成重大的公共卫生威胁。多重耐药菌不断出现进一步凸显了这一问题。产超广谱β-内酰胺酶大肠杆菌(ESBL-Ec)是一类关键优先级细菌,日益参与喀麦隆医院及社区环境中的危及生命感染。关于喀麦隆耐环丙沙星大肠杆菌遗传组成的数据有限。本研究旨在调查喀麦隆雅温得两家医院临床样本中分离获得的多重耐药大肠杆菌的流行率、遗传多样性及耐药机制。

方法 本研究于2025年2月至6月在喀麦隆雅温得两家医疗机构开展横断面研究。对住院和门诊患者的所有临床样本均进行分析。培养后,按照制造商说明使用API20E进行鉴定,并在CHROMagarTM ESBL上筛查ESBL产生。采用Kirby-Bauer纸片扩散法进行抗菌药物敏感性试验。通过聚合酶链式反应(PCR)检测ESBL和质粒介导的喹诺酮耐药(PMQR)基因,以及喹诺酮耐药决定区(QRDR)(gyrA/parC)中的突变。同时还研究了水平质粒转移。最后,进行了系统发育群分析。

结果 多重耐药大肠杆菌的流行率为50.7%(n=33/65),其中所有菌株(100%)均为ESBL产生菌,且91%对环丙沙星耐药。耐药率最高的药物为头孢噻肟(100%)、头孢曲松(100%)和环丙沙星(91%)。最常见的ESBL基因为blaTEM(36.3%;n=12/33)。在PMQR基因中,qnrB检出于16.6%(n=5/30)的分离株。仅ESBL基因由质粒携带;最常见的质粒携带基因为blaTEM(40%),其次为blaCTX-M(26.7%)。在拓扑异构酶QRDR(parC基因)中的突变检出于36.6%(n=11/30)的环丙沙星耐药菌株。系统发育群分析显示,A群占优势,其次为B群。

结论 本研究揭示了雅温得大肠杆菌中多重耐药、ESBL(以blaTEM为主)及氟喹诺酮耐药的高流行率,同时存在ESBL基因的质粒传播和PMQR决定因子的染色体稳定化。临床样本中共生型系统发育群的优势表明社区储存库发挥着重要作用。喀麦隆亟需强化“实时One Health”基因组监测。


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.07.743442v1?rss=1

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