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背景：非洲绿猴（African green monkey，AGM）正日益被用作阿尔茨海默病（AD）早期阶段的模型，其脑脊液（CSF）被用于生物标志物发现以及对中枢神经系统变化的纵向疾病监测。微小RNA（miRNA）尤其是早期神经病理变化的重要指示物。尽管早期疾病模型与能够捕捉早期变化的分子标志物具有互补价值，但AGM的miRNA组成（miRNome）尚未得到界定。我们利用死前采集的样本，通过miRNA测序和基于qRT-PCR的阵列建立了AGM脑脊液miRNome。我们还开发了一套分层注释流程，用于将miRNA分类为家族保守型或未分类，并评估其与人类及其他物种之间的序列比对情况。 结果：我们采用非靶向miRNA测序对AGM脑脊液miRNome进行了表征，鉴定出205种miRNA，可归入三类家族保守型类别：经典型（canonical）、非经典型（noncanonical）和3′末端变体（3'-terminal variants）。其中，150种也可通过人靶向qRT-PCR阵列检测到，从而为基于测序得到的miRNome提供了独立支持。测序丰度与qRT-PCR阵列Ct值在整体上显示出显著的跨平台一致性，尽管3′末端isomiR的一致性低于经典miRNA。与人类GTEx组织表达数据的比较表明，若干AGM脑脊液miRNA的人同源物表现出脑偏好性表达。值得注意的是，这些miRNA中许多的预测靶标富集于与神经退行性疾病相关的通路。最后，我们鉴定出20个未分类候选miRNA，无法归入既有miRNA家族，其中两个被我们提出为推定的新型miRNA。 结论：AGM脑脊液miRNome与人类miRNome在很大程度上是保守的，但同时也包含3′末端isomiR和未分类miRNA候选体。AGM脑脊液中含有与人类AD及其他神经病理相关miRNA同源的miRNA，凸显了该模型的转化潜力。然而，我们的研究也揭示了与物种特异性序列变异以及isomiR跨平台一致性降低相关的挑战。因此，需要开展比较研究，以验证这些miRNA跨物种的功能意义和生物标志物相关性。更广泛地说，这一初始miRNome为未来在疾病相关、生理、实验和进化背景下开展AGM miRNA研究提供了参考资源。
非洲绿猴脑脊液 miR 组捕获了与人类神经退行性疾病相关的保守 miRNA | bioRxiv
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非洲绿猴脑脊液 miR 组捕获了与人类神经退行性疾病相关的保守 miRNA
Sara Dzigurski， Rashid Al-Abri， Xiaoting Li， Monica R Grasty， Alice C Rodrigues， Michael R Weed， John D Elsworth， Matthew S Lawrence， Yujing J. Heng， Cristina S. Bogsan， Pourya Naderi Yeganeh， Winston A Hide， Frank J Slack， Gamze Gursoy， Andrew D Miranker， Bianca R. P. Brown
doi： https://doi.org/10.64898/2026.08.07.743104
Sara Dzigurski 1 耶鲁大学；
Rashid Al-Abri 2 哥伦比亚大学；
Xiaoting Li 3 剑桥大学；
Monica R Grasty 1 耶鲁大学；
Alice C Rodrigues 4 贝斯以色列女执事医疗中心，哈佛医学院；
Michael R Weed 5 Vriscio Inc.；
John D Elsworth 6 Virscio Inc.；
Matthew S Lawrence 6 Virscio Inc.；
Yujing J. Heng 7 贝斯以色列女执事医疗中心，哈佛医学院
Cristina S. Bogsan 7 贝斯以色列女执事医疗中心，哈佛医学院
Pourya Naderi Yeganeh 7 贝斯以色列女执事医疗中心，哈佛医学院
Winston A Hide 7 贝斯以色列女执事医疗中心，哈佛医学院
Frank J Slack 7 贝斯以色列女执事医疗中心，哈佛医学院
Gamze Gursoy 3 剑桥大学；
Andrew D Miranker 1 耶鲁大学；
Bianca R. P. Brown 1 耶鲁大学；
通讯请联系： biancarpalmerbrown{at}gmail.com
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摘要
背景：非洲绿猴（African green monkey, AGM）正越来越多地被用作阿尔茨海默病（AD）早期阶段的模型，其脑脊液（CSF）被用于生物标志物发现以及对中枢神经系统变化的纵向疾病监测。微小 RNA（miRNA）是早期神经病理变化中尤具信息价值的指标。尽管早期疾病模型与能够捕捉早期变化的分子标志物具有互补价值，但 AGM 的 miRNA 组成（miR 组）尚未被界定。我们利用死前采集的样持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本文依据 CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可协议提供。
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发布于 2026 年 8 月 13 日。
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Sara Dzigurski， Rashid Al-Abri， Xiaoting Li， Monica R Grasty， Alice C Rodrigues， Michael R Weed， John D Elsworth， Matthew S Lawrence， Yujing J. Heng， Cristina S. Bogsan， Pourya Naderi Yeganeh， Winston A Hide， Frank J Slack， Gamze Gursoy， Andrew D Miranker， Bianca R. P. Brown
bioRxiv 2026.08.07.743104； doi： https://doi.org/10.64898/2026.08.07.743104
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非洲绿猴脑脊液 miR 组捕获了与人类神经退行性疾病相关的保守 miRNA
Sara Dzigurski， Rashid Al-Abri， Xiaoting Li， Monica R Grasty， Alice C Rodrigues， Michael R Weed， John D Elsworth， Matthew S Lawrence， Yujing J. Heng， Cristina S. Bogsan， Pourya Naderi Yeganeh， Winston A Hide， Frank J Slack， Gamze Gursoy， Andrew D Miranker， Bianca R. P. Brown
bioRxiv 2026.08.07.743104； doi： https://doi.org/10.64898/2026.08.07.743104
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.07.743104v1?rss=1
🏷️ 脑脊液miRNA miRNome 非洲绿猴 阿尔茨海默病 保守miRNA