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寄生于昆虫的线虫分布广泛，且常常显著降低宿主适合度，然而我们对其中大多数物种的了解却出人意料地有限。Contortylenchus reversus 是一种栖居于血腔中的寄生线虫，可感染 Dendroctonus 属树皮甲虫，并显著影响宿主的活动能力与繁殖力。本文首先详细报道了 C. reversus 的染色体尺度基因组组装；该基因组是在一项以宿主（Dendroctonus ponderosae）为测序目标的项目中偶然获得的。我们将其 79.4 Mb 的基因组组装为 9 个连锁群，并借助转录组辅助注释鉴定出 11,244 个蛋白编码基因。与目前仅有完整组装的近缘类群进行共线性比较显示，其染色体发生了广泛重排，且基因共线性极度丧失，这表明这些寄生于昆虫的线虫可能具有异常易变的基因组。 利用该基因组组装，以及对来自 707 个 D. ponderosae 个体的简化基因组数据的再利用，我们研究了感染频率和种群结构，发现 18 个地理分布广泛的采集地点中，感染率范围为 0% 至 50%。C. reversus 的种群结构在总体上似乎与宿主甲虫的结构一致，这提示二者具有共享的进化历史；与此同时，与宿主相比，这种寄生线虫的遗传变异（核苷酸多样性）显著降低。这些结果为理解其种群遗传学、宿主关联以及线虫—甲虫相互作用的进化动态提供了见解，并凸显了基因组“副渔获”数据如何揭示复杂群落中一个重要物种此前隐藏的细节。
隐匿于基因组“兼捕”中的信息：关于寄生性线虫 Contortylenchus reversus 基因组重组与种群结构的见解。| bioRxiv
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隐匿于基因组“兼捕”中的信息：关于寄生性线虫 Contortylenchus reversus 基因组重组与种群结构的见解。
Yahir De Jesus Campusano ， German Lagunas-Robles ， Lewis Stevens ， Erik Ragsdale ， Ryan Bracewell
doi： https://doi.org/10.64898/2026.08.07.743562
Yahir De Jesus Campusano 1 印第安纳大学； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本文依据 CC-BY-NC 4.0 国际许可协议 提供。
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发布于 2026 年 8 月 13 日。 下载 PDF 补充材料 电子邮件
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Yahir De Jesus Campusano ， German Lagunas-Robles ， Lewis Stevens ， Erik Ragsdale ， Ryan Bracewell
bioRxiv 2026.08.07.743562； doi： https://doi.org/10.64898/2026.08.07.743562
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隐匿于基因组“兼捕”中的信息：关于寄生性线虫 Contortylenchus reversus 基因组重组与种群结构的见解。
Yahir De Jesus Campusano ， German Lagunas-Robles ， Lewis Stevens ， Erik Ragsdale ， Ryan Bracewell
bioRxiv 2026.08.07.743562； doi： https://doi.org/10.64898/2026.08.07.743562
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.07.743562v1?rss=1
🏷️ 寄生线虫 染色体级基因组组装 基因组重排 种群结构 宿主-寄生关系 核苷酸多样性