探索头颈部鳞状细胞癌进展中的脆弱蛋白质

一种其移除或缺失会导致蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络显著紊乱或崩溃的蛋白质，被称为脆弱蛋白。此类蛋白质可作为疾病相关网络中有价值的治疗或诊断靶点。在本研究中，构建了两个PPI网络，分别对应HPV阳性和HPV阴性的头颈鳞状细胞癌（HNSCC），并通过节点删除方法识别这些网络中的脆弱蛋白。网络分析后，在HPV阳性HNSCC中鉴定出27个特异性脆弱蛋白，在HPV阴性HNSCC中鉴定出72个特异性脆弱蛋白。其中，进一步整合多组学数据后，筛选出1个HPV阳性和7个HPV阴性HNSCC脆弱蛋白。为利用这些蛋白的脆弱性，预测了候选合成致死（SL）伙伴，其抑制可能选择性削弱肿瘤存活能力。随后，进行药物-基因相互作用分析，以识别针对这些脆弱蛋白SL伙伴的抑制剂。值得注意的是，在HPV阳性HNSCC中，TOP2A、CHEK1和CHEK2基因被鉴定为TTN的SL伙伴，且其抑制剂已获临床批准。而在HPV阴性HNSCC中，ADA和MMP19被鉴定为LMO7的SL伙伴；TMEM45B、CDH3和ELF3基因被鉴定为CGN的SL伙伴；ZNF433被鉴定为FLNC的SL伙伴。然而，尚未报道MMP19、ZNF433和TMEM45B的抑制剂。因此，这些脆弱蛋白及其SL伙伴为探索和开发更高效、更精准的治疗与诊断策略提供了新的途径。

一种蛋白质，若其去除或删除会导致蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络发生显著破坏或崩溃，则称为脆弱蛋白。此类蛋白质可作为疾病相关网络中有价值的治疗或诊断靶点。在本研究中，构建了两个PPI网络，分别对应HPV阳性和HPV阴性的头颈鳞状细胞癌（HNSCC），并通过节点删除方法鉴定了这些网络中的脆弱蛋白。网络分析后，鉴定出HPV阳性HNSCC中27个特异性脆弱蛋白，以及HPV阴性HNSCC中72个特异性脆弱蛋白。其中，进一步整合多组学数据后，筛选出1个HPV阳性和7个HPV阴性HNSCC脆弱蛋白。为利用这些蛋白的脆弱性，预测了候选合成致死（SL）伙伴，其抑制可能选择性削弱肿瘤存活能力。随后，开展药物-基因相互作用分析，以识别靶向这些脆弱蛋白SL伙伴的抑制剂。值得注意的是，在HPV阳性HNSCC中，TOP2A、CHEK1和CHEK2基因被鉴定为TTN的SL伙伴，且其抑制剂已获得临床批准。而在HPV阴性HNSCC中，ADA和MMP19被鉴定为LMO7的SL伙伴；TMEM45B、CDH3和ELF3基因被鉴定为CGN的SL伙伴；ZNF433被鉴定为FLNC的SL伙伴。然而，尚未报道MMP19、ZNF433和TMEM45B的抑制剂。因此，这些脆弱蛋白及其SL伙伴为探索和开发更高效、更精准的治疗与诊断策略提供了新的途径。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.07.743269v1?rss=1

🏷️ 头颈鳞癌 脆弱蛋白 蛋白互作网络 合成致死 多组学整合 药物-基因相互作用