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荧光指示剂和光学显微技术的最新进展现已能够对谷氨酸进行体内突触成像;谷氨酸传递了脑内神经元之间的大多数信号。由于突触在树突上的尺度极其微小且密集聚集,以及行为动物中存在的脑运动,从这些记录中提取荧光信号变得复杂。本文提出谷氨酸成像分析工具箱(Glutamate Imaging Analysis Toolbox, GIAnT),这是一套用于谷氨酸成像数据的自动化工具,能够校正样本运动、以超分辨率精度识别活跃突触,并提取突触荧光信号。与面向细胞成像设计的方法相比,GIAnT可减少运动伪影,更准确地识别活跃突触,并通过降低来自重叠突触的污染来提高提取信号的质量。通过将体内谷氨酸成像与事后扩增显微镜结合,我们发现,使用GIAnT提取的假定突触中有超过70%与突触后细胞上的谷氨酸能突触呈一一对应关系。我们的结果确立了GIAnT作为一种自动化且经过验证的流程,可用于大规模处理突触谷氨酸成像数据。
1 约翰斯·霍普金斯大学生物医学工程系,美国马里兰州巴尔的摩;Allen Institute,神经动力学,美国华盛顿州西雅图; 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方,其已授予 bioRxiv 以永久展示该预印本的许可。 该内容采用 CC-BY 4.0 国际许可协议 发布。
返回顶部 上一页 下一页 发布于 2026 年 8 月 13 日。 下载 PDF 电子邮件 感谢您有兴趣传播 bioRxiv 上的内容。 您的电子邮件 * 您的姓名 * 发送至 * 可将多个地址分行输入,或用逗号分隔。 您将发送以下内容的电子邮件 GIAnT:谷氨酸成像分析工具箱 消息主题 (您的姓名)已从 bioRxiv 将一个页面转发给您 消息正文 (您的姓名)认为您会想查看 bioRxiv 网站上的此页面。 您的个人留言 验证码 此问题用于测试您是否为真人访问者,并防止自动化垃圾提交。 分享 GIAnT:谷氨酸成像分析工具箱 Michael E. Xie , Johannes Friedrich , Elizabeth Wirsching , Caleb Jones Shibu , Maedeh Seyedolmohadesin , Naveen Ouellette , Tim Wang , Karel Svoboda , Adam S Charles , Kaspar Podgorski bioRxiv 2026.08.07.743580; doi: https://doi.org/10.64898/2026.08.07.743580 分享本文: 复制 引文工具 GIAnT:谷氨酸成像分析工具箱 Michael E. Xie , Johannes Friedrich , Elizabeth Wirsching , Caleb Jones Shibu , Maedeh Seyedolmohadesin , Naveen Ouellette , Tim Wang , Karel Svoboda , Adam S Charles , Kaspar Podgorski bioRxiv 2026.08.07.743580; doi: https://doi.org/10.64898/2026.08.07.743580
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