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对乳杆菌科（Lactobacillaceae）的认识在很大程度上依赖于来自食品以及少数被反复采样宿主的分离株。参考数据库会将一个未被识别的序列命名为其最近缘类群的名称，因此，一个尚无自身条目的谱系会被重新命名，而不是被标记出来。在此，我们对公共植物和无脊椎动物扩增子记录中的该科进行分类，以定位携带未描述谱系的宿主。 在3,344项相互独立的16S rRNA基因扩增子研究中，我们将每一个序列簇与模式菌株参考序列进行比对，并将其归入其所支持的最深分类阶元。在204,813个已分类序列簇中，20,516个被命名到种水平，127,906个被命名到属水平，而4,741个与任何已描述物种均不匹配。本文在此重新分类了6个已发表的数据集；在这些数据集中，其作者只能将其中的乳杆菌科成员鉴定为Lactobacillus，或者根本无法进行命名。 一些最初描述于单一生境的属实际上分布远超该生境；其中，3个与蜜蜂相关的属出现在蔷薇科（Rosaceae）和十字花科（Brassicaceae）植物上的频率，是其出现在风媒禾草上的数倍，而我们未发现任何已发表的来自植物的Bombilactobacillus记录。未描述谱系集中存在于培养最少的宿主中，在无刺蜂Melipona和Tetragonula中，分别有86.1%和77.4%的研究检测到此类谱系；这些谱系在龟蚁Cephalotes中表现出最高的分化程度，而在植物中则以茶树Camellia最为显著。一项针对罐蜜（pot honey）的独立基因组解析调查也得出了相同的两个属。 来自这些宿主的48个物种的一手描述中，都明确规定了需使用补充培养基，因此，携带未描述谱系的宿主也同时提示了如何对这些谱系进行培养。
对乳杆菌科（Lactobacillaceae）的认识，在很大程度上依赖于来自食物以及少数被反复采样宿主的分离株。参考数据库会将一条未被识别的序列命名为其最近缘类群的名称，因此，一个在数据库中没有独立条目的谱系不会被标记出来，而是会被重新命名。在本研究中，我们对公开的植物和无脊椎动物扩增子记录中的乳杆菌科进行了分类，以定位携带未描述谱系的宿主。
在3,344项相互独立的16S rRNA基因扩增子研究中，我们将每个序列簇与模式菌株参考数据库进行比对，并将其归入其所支持的最深分类等级。在204,813个已分类的序列簇中，20,516个被命名到物种水平，127,906个被命名到属水平，而有4,741个与任何已描述物种均不匹配。本文还重新分类了6个已发表数据集；这些数据集的作者只能将其乳杆菌科成员命名为Lactobacillus，或者根本无法命名。
最初描述自单一生境的属，其实际分布远超该生境；3个与蜜蜂相关的属出现在蔷薇科（Rosaceae）和十字花科（Brassicaceae）植物上的频率，是其出现在风媒禾草上的数倍，而我们未发现任何已发表的来自植物的Bombilactobacillus记录。未描述谱系集中出现在培养研究最少的宿主中，在无刺蜂Melipona和Tetragonula中，分别达到86.1%和77.4%的研究；其分化程度最高的宿主则是龟蚁Cephalotes，而在植物中则是茶树，即Camellia。一项针对蜂蜜罐蜜（pot honey）的独立基因组解析调查，在同样的两个属上得出了趋同结论。来自这些宿主的48个物种的原始描述中，均指明需使用补充培养基，因此，携带未描述谱系的宿主也同时提示了如何对其进行培养。
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.12.744358v1?rss=1
🏷️ 乳杆菌科 16S rRNA扩增子 未描述谱系 宿主关联菌群 无刺蜂 茶树