SPLISOFORMS：可变剪接异构体的结构解析知识库

背景：可变剪接将单个基因的编码能力扩展为多样化的蛋白质家族，其失调已被公认为癌症的标志性特征之一。尽管如此，对剪接变体的表征在很大程度上仍局限于序列层面的注释。异构体的功能后果，如结构稳定性、结构域保留、成药性以及新表位呈递，本质上都与其三维结构相关。然而，现有的大规模结构数据库严格限于对经典蛋白的建模。 结果：SPLISOFORMS 通过整合癌症长读长转录组数据与 AlphaFold 3 预测，系统性地描绘了可变剪接的结构与功能后果，从而解决了这一局限。该资源目前收录了 124,687 个异构体结构，并对其结构域、内在无序、无义介导的降解、翻译后修饰、新抗原、药物结合口袋及相互作用进行了注释。通过实现每个新型异构体与其经典对应体之间的残基水平比较，该数据库使每一个剪接事件的结构影响都能够被明确查询。 结论：SPLISOFORMS 可通过 https://splisoforms.org 及 REST API 免费访问，弥合了序列层面转录组发现与蛋白质功能之间的鸿沟。它提供了一个全面的结构框架，可支持癌症、免疫治疗及药物发现研究人员进行假设生成与靶点选择。

背景：可变剪接将单个基因的编码能力扩展为多样化的蛋白质家族，而其失调已被公认为癌症的一个标志性特征。尽管如此，对剪接变体的表征在很大程度上仍局限于序列层面的注释。蛋白质异构体的功能后果，例如结构稳定性、结构域保留、成药性以及新表位呈递，本质上都与其三维结构密切相关。然而，现有的大规模结构数据库仅对标准蛋白进行建模。

结果：SPLISOFORMS 通过整合癌症长读长转录组数据与 AlphaFold 3 预测，系统性地描绘了可变剪接的结构与功能后果，从而解决了这一局限性。该资源目前收录了 124,687 个异构体结构，并标注了结构域、内在无序、无义介导的降解、翻译后修饰、新抗原、药物结合口袋以及相互作用等信息。通过支持对每个新型异构体及其标准对应体进行残基水平的比较，该数据库使每一个剪接事件的结构影响都能够被明确查询。

结论：SPLISOFORMS 可通过 https://splisoforms.org 及 REST API 免费访问，弥合了序列层面转录组发现与蛋白质功能之间的鸿沟。它提供了一个全面的结构框架，可支持癌症、免疫治疗及药物发现研究中的假设生成与靶点筛选。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.06.743218v1?rss=1

🏷️ 可变剪接 异构体结构预测 AlphaFold 3 癌症转录组 新抗原注释 结构数据库