RelB邻近蛋白质组学和CRISPR筛选界定了调控HIV潜伏与再激活的非经典NF-κB通路染色质调控因子

root 提交于 周四, 08/13/2026 - 00:47
通过SMAC模拟物(如AZD5582)经由RelB/p52信号激活非经典NF-κB通路,是诱导潜伏HIV表达的一种有前景的策略,但连接RelB/p52与前病毒调控的染色质机制仍未得到充分界定。本文结合RelB BioID蛋白质组学、靶向HIV-CRISPR筛选以及药理学验证,鉴定出与ncNF-κB相关的HIV表达调控因子。RelB BioID揭示了在基础状态和AZD5582激活状态下,染色质与转录调控因子之间存在广泛的相互作用网络。与RelB基础相关的蛋白包括NSD2、SWI/SNF组分、UHRF1和DNMT1,而AZD5582富集的蛋白包括p300、USP7、LSD1/KDM1A、NuRD组分、SIN3A以及HBO1/KAT7。采用针对所有BioID鉴定因子的自定义导向RNA文库进行功能筛选,鉴定出促进HIV再激活的调控因子,包括HBO1/KAT7、NSD2和SIN3A,以及限制HIV表达的调控因子,包括p300、CHD4和USP7。由于KAT7/HBO1和p300均编码具有相反筛选表型的乙酰转移酶,我们检测了其催化活性是否参与HIV转录调控,结果发现,与CRISPR筛选一致,KAT7/HBO1抑制会降低AZD5582诱导的再激活,而p300抑制则增强该过程。总体而言,这些数据构建了一个将RelB相关染色质景观与HIV潜伏及再激活联系起来的资源。

通过SMAC模拟物(如AZD5582)经由RelB/p52信号激活非经典NF-{kappa}B通路,是诱导潜伏HIV表达的一种有前景的策略,但将RelB/p52与前病毒调控联系起来的染色质机制仍未得到充分阐明。本文结合RelB BioID蛋白组学、靶向HIV-CRISPR筛选以及药理学验证,鉴定出与ncNF-{kappa}B相关的HIV表达调控因子。RelB BioID揭示了在基础状态和AZD5582激活状态下,染色质与转录调控因子之间存在广泛的相互作用网络。基础状态下与RelB相关的蛋白包括NSD2、SWI/SNF组分、UHRF1和DNMT1,而AZD5582富集的蛋白包括p300、USP7、LSD1/KDM1A、NuRD组分、SIN3A和HBO1/KAT7。采用靶向所有BioID鉴定因子的定制sgRNA文库进行功能筛选,识别出促进HIV再激活的调控因子,包括HBO1/KAT7、NSD2和SIN3A,以及限制HIV表达的调控因子,包括p300、CHD4和USP7。由于KAT7/HBO1和p300均编码乙酰转移酶且在筛选中表现出相反的表型,我们进一步检测其催化活性是否参与HIV转录调控,结果发现,与CRISPR筛选一致,KAT7/HBO1抑制会降低AZD5582诱导的再激活,而p300抑制则增强该效应。总体而言,这些数据构建了一个资源框架,将RelB相关染色质景观与HIV潜伏及再激活联系起来。


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.11.744217v1?rss=1

🏷️ HIV潜伏 非经典NF-κB通路 RelB蛋白质组学 CRISPR筛选 染色质调控 病毒再激活