龋病相关口腔生态位中的生态轨迹与微生物网络重组

龋齿是一种由生物膜介导、与口腔微生物组生态变化相关的疾病。健康菌斑、龋相关菌斑与龋坏牙本质之间的微生物群落组织差异尚未得到充分界定。我们采用16S rRNA基因测序，对龋病患者的配对龈上菌斑和龋坏牙本质样本进行谱系分析，并纳入健康对照的龈上菌斑样本。与健康菌斑相比，龋相关菌斑表现出更高的多样性，而龋坏牙本质中的多样性较低。生态排序分析将这三类样本定位于一个沿健康—菌斑—牙本质连续变化的梯度上。关联网络分析显示，龋相关菌斑和龋坏牙本质具有不同的网络结构，其中牙本质网络表现出更高的密度和更低的模块化程度。通过整合差异丰度分析和网络中心性结果，我们鉴定出与牙本质生态位相关的分类群。基于三个属构建的稀疏逻辑回归模型，在按患者分组的交叉验证中能够区分菌斑与牙本质（AUROC，0.780；AUPRC，0.718）。这些横断面研究结果描述了龋齿中与生态位相关的微生物组组织特征，并为未来在独立且具有临床相关性的队列中进行验证提供了候选特征。

龋齿是一种由生物膜介导、与口腔微生物组生态变化相关的疾病。健康菌斑、龋相关菌斑和龋坏牙本质之间的微生物群落组织差异尚未得到充分界定。我们采用16S rRNA基因测序，对龋病患者的配对龈上菌斑和龋坏牙本质样本进行谱系分析，并纳入健康对照者的龈上菌斑样本。与健康菌斑相比，龋相关菌斑表现出更高的多样性，而龋坏牙本质中的多样性则较低。生态排序分析将这三类样本定位于一个沿着健康—菌斑—牙本质连续体分布的梯度上。关联网络分析显示，龋相关菌斑与龋坏牙本质具有不同的网络结构，其中牙本质网络表现出更高的密度和更低的模块化程度。通过整合差异丰度分析与网络中心性结果，我们鉴定出与牙本质生态位相关的分类群。采用包含三个属的稀疏逻辑回归模型，在按患者分组的交叉验证中区分菌斑与牙本质（AUROC，0.780；AUPRC，0.718）。这些横断面研究结果描述了龋齿中与生态位相关的微生物组组织特征，并为未来在独立且具有临床相关性的队列中进行验证提供了候选特征。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.12.744380v1?rss=1

🏷️ 龋病 口腔微生物组 16S rRNA测序 生态位梯度 微生物网络 牙本质菌群