黑豆蚜Aphis fabae的染色体组装

黑豆蚜 Aphis fabae 是一种作物害虫，也是昆虫传播病原体的媒介，由若干亲缘关系密切且寄主范围相互重叠的亚种组成。在其他蚜属（Aphis）物种中，特定解毒基因的过表达已被证明与杀虫剂耐受性相关。我们基于 HiFi 和 Hi-C 测序技术，构建了一个 A. fabae 克隆系的两个染色体尺度组装，分别代表两个分相单倍型。结合 PacBio Iso-Seq 数据建立的全面基因组注释，被用于研究杀虫剂耐受性相关基因。两个基因组均由四个染色体区块组成（单倍型 1：427 Mb；单倍型 2：396 Mb），且具有较高的 BUSCO 完整性（98.7%）。比较基因组学分析揭示了 UDP-糖基转移酶家族的扩张，而该家族的表达在其他蚜属物种中与杀虫剂解毒相关。这些高质量参考基因组为研究 A. fabae 各亚种提供了基础，也为探究蚜属范围内的杀虫剂耐受性提供了基因组资源。

黑豆蚜（Aphis fabae）是一种作物害虫，也是昆虫传播病原体的媒介，由若干亲缘关系密切且寄主范围相互重叠的亚种构成。在其他蚜属（Aphis）物种中，特定解毒基因的过表达已被证实与杀虫剂耐受性相关。

我们利用 HiFi 和 Hi-C 测序技术，对一个克隆系 A. fabae 品系构建了两个染色体尺度的基因组组装，分别代表两个分相单倍型。基于 PacBio Iso-Seq 数据构建的全面基因组注释被用于研究杀虫剂耐受性相关基因。两个基因组均由四个染色体区块组成（单倍型1：427 Mb；单倍型2：396 Mb），且具有较高的 BUSCO 完整度（98.7%）。比较基因组学分析揭示了 UDP-糖基转移酶家族的扩张，而在其他蚜属物种中，该家族基因的表达与杀虫剂解毒相关。这些高质量参考基因组为研究 A. fabae 各亚种提供了基础，也为探究蚜属范围内的杀虫剂耐受性提供了基因组资源。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.05.743085v1?rss=1

🏷️ 染色体组装 蚜虫基因组 HiFi测序 Hi-C测序 杀虫剂耐受性 比较基因组学