用于表征肯尼亚西部血吸虫种群中吡喹酮分子靶标TRPMPZQ突变的混合扩增子测序

由 root 提交于 周一, 08/10/2026 - 00:47
使用吡喹酮(Praziquantel, PZQ)开展的大规模药物治疗(mass drug administration, MDA)是消除血吸虫病工作中的核心措施。然而,在非洲许多地区——包括肯尼亚西部——均有报道称存在对MDA应答不佳的区域(“持续热点”)。对于持续热点的一种可能解释是,这些地区存在对PZQ具有耐药性的血吸虫寄生虫。近期研究表明,Sm.TRPMPZQ基因是PZQ作用于血吸虫寄生虫的分子靶点,且该基因中的突变可导致PZQ耐药。 本研究对采集自肯尼亚西部西亚亚县热点村和非热点村的23,420个毛蚴中的Sm.TRPMPZQ突变进行了表征。我们从5个热点村的135名受试者中采集了三重复混合样本,每个样本池平均包含780.67个(标准差[SD] ± 183.47)毛蚴;这些村庄尽管已接受超过5次年度治疗,曼氏血吸虫(S. mansoni)流行率仍然较高。同时,我们还从5个非热点村的62名受试者中采集样本,这些村庄在年度治疗后流行率有所下降。我们从每个毛蚴混合样本中提取DNA,扩增覆盖Sm.TRPMPZQ跨膜结构域1,695 bp区域的15个扩增子,并在KEMRI-CGHR使用MiSeq进行高测序深度(21,110×)测序。 我们鉴定出5个高置信度(频率[≥] 0.01)的Sm.TRPMPZQ变异。其中包括4个同义变异和1个非同义变异(p.L1476I)。在非热点村(0.040 ± 0.006)和热点村(0.044 ± 0.0050)中,p.L1476I的频率相近(Mann-Whitney U = 18,p = 0.31),且在Ca2+报告系统检测中不影响对PZQ的反应。我们的研究表明,在本研究地点中,Sm.TRPMPZQ中的耐药相关变异极为罕见或不存在,因此不能解释该地区持续热点的存在。

使用吡喹酮(Praziquantel, PZQ)进行的大规模药物治疗(mass drug administration, MDA)是消除血吸虫病工作的核心。然而,在非洲许多地区——包括肯尼亚西部——均已报道对MDA反应不佳的区域(“持续热点”)。对这些持续热点的一种可能解释是,这些地区存在对PZQ耐药的血吸虫寄生虫。近期研究表明,Sm.TRPMPZQ基因是PZQ在血吸虫寄生虫中的分子靶点,且该基因中的突变可导致PZQ耐药。

本研究对采自肯尼亚西部西亚亚县热点村和非热点村的23,420个毛蚴中的Sm.TRPMPZQ突变进行了表征。我们从5个热点村的135名受试者中收集了三重复混合样本,每个混合样本平均包含780.67个毛蚴(标准差[±] 183.47);这些村庄尽管已接受超过5次年度治疗,曼氏血吸虫(S. mansoni)感染率仍然较高。同时,我们还从5个非热点村的62名受试者中收集了样本,在这些村庄中,年度治疗已使感染率下降。我们从每个毛蚴混合样本中提取DNA,扩增了覆盖Sm.TRPMPZQ跨膜结构域1,695 bp区域的15个扩增子,并在KEMRI-CGHR使用MiSeq进行高测序深度(21,110×)测序。

我们鉴定出5种高可信度(频率[≥] 0.01)的Sm.TRPMPZQ变异。其中包括4种同义变异和1种非同义变异(p.L1476I)。p.L1476I在非热点村(0.040 [±] 0.006)和热点村(0.044 [±] 0.0050)中的频率相近(Mann–Whitney U=18,p=0.31),且在Ca2+报告分析中不影响PZQ应答。我们的研究表明,在所研究地点中,Sm.TRPMPZQ中的耐药变异非常罕见或不存在,因此无法解释该地区热点的存在。


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.04.742841v1?rss=1

🏷️ 血吸虫病 吡喹酮耐药 TRPMPZQ突变 混合扩增子测序 曼氏血吸虫