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番茄和辣椒细菌性斑点病（BST/P）是一种在经济上具有毁灭性影响的病害，由四种不同的黄单胞菌病原体引起：X. euvesicatoria pv. euvesicatoria（Xe）、X. euvesicatoria pv. perforans（Xp）、X. hortorum pv. gardneri（Xg）和 X. vesicatoria（Xv）。这些病原体毒力的一个关键组成部分是 III 型分泌系统（T3SS），该系统可将 III 型效应子（T3E）蛋白递送至寄主植物细胞内。为全面表征 T3E 组成并在群体尺度上评估核心效应子的稳定性，我们分析了一个全球数据集，其中包含 1,037 个经过质量筛选的基因组，包括 585 株 Xp、350 株 Xe、69 株 Xg 和 33 株 Xv 菌株。在该集合中，6 种效应子的编码基因存在于 100% 的受检基因组中（XopK、XopL、XopM、XopN、XopX 和 XopZ1），另有 4 种效应子的编码基因存在于[≥]95% 的基因组中（XopK、XopL、XopM、XopN、XopX 和 XopZ1）。Xp 和 Xe 群体维持了庞大的总效应子库，并具有广泛的等位变异，其中 XopD 和 XopAD 表现出显著的多态性。相比之下，Xg 和 Xv 表现出高度稳定的效应子谱，在不同地理区域和年代间的等位多样化明显减少。破坏性突变，包括提前终止密码子和移码突变，在 XopAZ、XopAF 和 XopAR 的编码基因中于特定病原体中普遍存在，这表明假基因化和定向基因丢失仍在持续进行。这些发现对 BST/P 病原体效应子库中保守与可变组分进行了高分辨率表征，并为监测群体进化以及培育针对多种病原体的持久抗病性奠定了基础。
番茄和辣椒细菌性斑点病（bacterial spot of tomato and pepper, BST/P）是一种在经济上具有毁灭性影响的病害，由四种不同的黄单胞菌病原体引起：X. euvesicatoria pv. euvesicatoria（Xe）、X. euvesicatoria pv. perforans（Xp）、X. hortorum pv. gardneri（Xg）和X. vesicatoria（Xv）。这些病原体毒力的一个关键组成部分是Ⅲ型分泌系统（type III secretion system, T3SS），该系统可将Ⅲ型效应蛋白（type III effector, T3E）递送至寄主植物细胞内。为了全面表征T3E库，并在人群尺度上评估核心效应子的稳定性，我们分析了一个全球数据集，其中包含1,037个经质量筛选的基因组，包括585株Xp、350株Xe、69株Xg和33株Xv菌株。在这一集合中，6种效应子的编码基因存在于100%的受检基因组中（XopK、XopL、XopM、XopN、XopX和XopZ1），另有4种效应子存在于≥95%的基因组中（XopK、XopL、XopM、XopN、XopX和XopZ1）。Xp和Xe群体维持了庞大的总效应子库，并具有广泛的等位变异，其中XopD和XopAD表现出显著的多态性。相比之下，Xg和Xv表现出高度稳定的效应子谱，在不同地理区域和年代间的等位多样化明显减少。破坏性突变，包括提前终止密码子和移码突变，在XopAZ、XopAF和XopAR的编码基因中于特定病原体内普遍存在，表明持续进行的假基因化和定向基因丢失。这些发现高分辨率地刻画了BST/P病原体效应子武库中保守和可变的组成部分，并为监测群体进化以及培育针对多种病原体的持久抗病性奠定了基础。
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.04.742720v1?rss=1
🏷️ 黄单胞菌 细菌性斑点病 III型效应子 等位多样性 群体基因组学 植物病原菌