ABC1K7：一种在椰子驯化过程中被精细调控的、历经3.5亿年的叶绿体变阻器

多年生作物遵循着不同于一年生作物的驯化轨迹，然而，慢变量驯化的分子基础——即对保守性调控枢纽进行细微调节——仍缺乏充分表征。我们重建了叶绿体激酶ABC1K7在9种种子植物、跨越约3.5亿年进化历程中的演化历史，采用了PAML密码子模型、IQ-TREE稳健密码子模型以及蛋白质水平的系统发育推断，并结合AlphaFold2结构建模。ABC1K7在所有种子植物中均受到极强的纯化选择（ω = 0.073–0.104）。在椰子中，位点652处一个Y到F的单一替换——位于距催化核心30 Å以上的一个预测内在无序区——构成了椰子与8个被子植物直系同源物中的7个之间唯一的非同义变化，并在一个为期17年的育种群体（n = 327）中与驯化性状表现出完全共分离。上述结果提供了与慢变量驯化模型一致的群体水平证据，并鉴定出ABC1K直系同源物可作为多年生作物改良的靶标。

多年生作物遵循着不同于一年生作物的驯化轨迹，然而，缓变型驯化的分子基础——即对保守调控枢纽进行细微调节——仍然缺乏清晰表征。我们重建了叶绿体激酶ABC1K7在9种种子植物、跨越约3.5亿年演化历程中的进化历史，并采用了PAML密码子模型、IQ-TREE稳健密码子模型以及蛋白质水平的系统发育推断，同时结合AlphaFold2结构建模。ABC1K7在所有种子植物中均受到极强的纯化选择作用（ω = 0.073–0.104）。在椰子中，位于残基652处的一个Y到F的单一氨基酸替换——该位点位于距催化核心30 Å以上的预测内在无序区域——是区分椰子与8个被子植物直系同源基因中7个的唯一非同义变化，并且在一个为期17年的育种群体（n = 327）中与驯化性状呈现完全共分离。上述发现提供了与缓变型驯化模型一致的群体水平证据，并将ABC1K直系同源基因鉴定为多年生作物改良的靶标。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.04.742752v1?rss=1

🏷️ 椰子驯化 叶绿体激酶ABC1K7 纯化选择 系统发育分析 多年生作物 AlphaFold2结构建模