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研究动机：激酶调控大量蛋白质功能，其失调对许多人类疾病的发生具有关键作用。然而，直接测量激酶活性通常具有较大挑战，因此，根据其底物的行为来推断激酶活性是一种被广泛采用的策略。尽管如此，传统方法通常过度简化其底层网络结构，忽略了任一特定底物都可能被多个激酶磷酸化这一事实。 结果：我们提出了LIKA，一种基于似然的框架，用于从磷酸蛋白质组学数据中推断激酶活性。通过对激酶—底物相互作用的多对多结构进行建模，LIKA即使在数据有限的情况下也能实现高效推断，同时捕捉网络复杂性。模拟研究和细胞系分析证实了LIKA的稳健性和准确性。重要的是，对来自精神分裂症患者和对照受试者的磷酸蛋白质组学数据集的分析揭示了新的失调激酶。 可获得性与实现：实现代码和公开可用的数据见：https://github.com/lujingz/LIKA。
使用 LIKA 推断有向图的扰动揭示了精神分裂症中改变的蛋白质磷酸化网络 | bioRxiv
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使用 LIKA 推断有向图的扰动揭示了精神分裂症中改变的蛋白质磷酸化网络
Lujing Zhang，Andrew G. Demarco，Kimia Ghafari，Bernie Devlin，Matthew L MacDonald，Kathryn Roeder
doi： https://doi.org/10.64898/2026.08.06.743374
Lujing Zhang 1 卡内基梅隆大学； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本文依据 CC-BY 4.0 国际许可协议 发布。
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发布于 2026 年 8 月 7 日。
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Lujing Zhang，Andrew G. Demarco，Kimia Ghafari，Bernie Devlin，Matthew L MacDonald，Kathryn Roeder
bioRxiv 2026.08.06.743374； doi： https://doi.org/10.64898/2026.08.06.743374
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Lujing Zhang，Andrew G. Demarco，Kimia Ghafari，Bernie Devlin，Matthew L MacDonald，Kathryn Roeder
bioRxiv 2026.08.06.743374； doi： https://doi.org/10.64898/2026.08.06.743374
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.06.743374v1?rss=1
🏷️ 磷酸蛋白质组学 激酶活性推断 有向图模型 精神分裂症 蛋白质磷酸化 似然框架