候选种 Steroidedax gorgoniicola：一种具有从 Endozoicomonadaceae 水平获得基因的异养性珊瑚共生体

珊瑚与许多细菌存在关联，但由于缺乏基因组资源，这些细菌的进化历史及其在全生物体中的作用尚不明确。一个例子是BD1-7支系，该支系在某些珊瑚微生物宏条形码文库中被发现，并被推测具有光养能力。为评估其系统发育位置并解析其代谢能力，我们组装并注释了一个被归类为BD1-7的八放珊瑚共生菌基因组。其完整基因组显示，它实际上代表了一个独特且高度分化的、广泛存在于珊瑚相关群落中的支系。我们提议将这一与Swiftia exserta相关的共生菌命名为Ca. Steroidedax gorgoniicola。 与真正的BD1-7支系不同，其基因组不编码任何利用光产生ATP的通路，反而表明它很可能是一种异养生物，能够降解类固醇、几丁质和胶原蛋白，并能产生毒素或抗菌化合物，同时解毒多种活性氧和活性氮物种。此外，我们鉴定出若干很可能来源于Endozoicomonadaceae的水平转移基因，其中包括转座酶以及参与毒力和细胞黏附的基因。这项研究揭示了水平基因转移在共生进化中的潜在作用，并强调了获取基因组数据对于解析珊瑚相关谱系及其代谢能力的重要性。

珊瑚与许多细菌相关联，但由于缺乏基因组资源，这些细菌的进化历史及其在全生物体中的作用尚不清楚。一个例子是BD1-7类群，该类群在一些珊瑚微生物宏条形码文库中被发现，并被推测具有光养能力。为评估其系统发育位置并分析其代谢能力，我们组装并注释了一个被归类为BD1-7的八放珊瑚共生关联菌基因组。其完整基因组显示，它实际上代表了一个独特且分化显著的广泛分布的珊瑚关联菌类群。我们提议将这一与Swiftia exserta相关联的菌命名为Ca. Steroidedax gorgoniicola。

与真正的BD1-7类群不同，其基因组未编码任何利用光产生ATP的途径，反而表明它很可能是一种异养生物，能够降解类固醇、几丁质和胶原蛋白，同时还能产生毒素或抗菌化合物，并解毒多种活性氧和活性氮物种。此外，我们鉴定出若干很可能来自Endozoicomonadaceae的水平转移基因，包括转座酶以及参与毒力和细胞黏附的基因。这项工作揭示了水平基因转移在共生关系演化中的潜在作用，并强调了获取基因组数据对于解析珊瑚相关类群及其代谢能力的重要性。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.06.743379v1?rss=1

🏷️ 珊瑚共生菌 水平基因转移 基因组组装 异养代谢 Endozoicomonadaceae