lamin相关多肽2α的缺失导致染色质重组以及A型lamin与开放基因组区域的结合

背景：核纤层蛋白是染色质空间与功能组织的主要调控因子。位于核周边的核纤层蛋白形成核纤层，将异染色质锚定于核膜上。A型核纤层蛋白的一个亚群定位于核内部，在那里它们也与常染色质基因组区域结合。A型核纤层蛋白的性质及其与染色质的结合受核纤层相关多肽2α（LAP2）调控。在本研究中，我们系统分析了LAP2缺失如何在全基因组水平影响染色质组织、可及性和基因表达。 结果：在小鼠真皮成纤维细胞中，LAP2缺失对全基因组范围内的染色质可及性和基因表达均产生正向和负向影响，这与A型核纤层蛋白以及核小体重塑蛋白BRG1和CHD4的染色质结合变化相关。特别是，A型核纤层蛋白结合于靠近BRG1和CHD4结合位点以及失调基因的开放染色质区域，但并不直接富集于基因本身及BRG1和CHD4富集位点上。对LAP2结合基因组区域的数据集进行无监督聚类分析证实，A型核纤层蛋白向含有失调基因的活性染色质区域扩散，并且染色质重塑因子在其中一部分基因组区域上富集。 结论：成纤维细胞中LAP2缺失会导致染色质发生广泛重排。全基因组范围的染色质重组与A型核纤层蛋白向活性染色质区域扩散有关，并伴随着染色质重塑因子局限于部分活性基因组区域。这些变化与全基因组范围内染色质可及性和基因表达的改变相关，尤其是在与野生型细胞相比于LAP2敲除细胞中获得核纤层蛋白结合的区域。

背景：核纤层蛋白是染色质空间与功能组织的主要调控因子。位于核周边的核纤层蛋白形成核纤层，将异染色质锚定于核膜。A型核纤层蛋白的一个亚群定位于核内部，在那里它们也与常染色质基因组区域结合。A型核纤层蛋白的特性及其与染色质的关联受核纤层蛋白相关多肽2α（LAP2）调控。本研究在全基因组水平系统分析了LAP2耗竭如何影响染色质组织、可及性和基因表达。

结果：在小鼠真皮成纤维细胞中，LAP2耗竭在全基因组范围内对染色质可及性和基因表达产生正向和负向影响，这与A型核纤层蛋白以及核小体重塑蛋白BRG1和CHD4的染色质结合变化相关。特别是，A型核纤层蛋白结合于接近BRG1和CHD4结合位点以及失调基因的开放染色质区域，但并不直接积聚于基因本身及BRG1和CHD4富集位点上。对LAP2结合的基因组区域进行数据集的无监督聚类分析证实，A型核纤层蛋白扩散至含有失调基因的活性染色质区域，并且染色质重塑因子在其中一部分基因组区域上富集。

结论：成纤维细胞中LAP2耗竭导致染色质发生广泛重排。全基因组范围的染色质重组与A型核纤层蛋白向活性染色质区域扩散有关，并伴随着染色质重塑因子局限于部分活性基因组区域。这些变化与全基因组范围内染色质可及性和基因表达的改变相关，尤其是在与野生型细胞相比LAP2敲除细胞中获得核纤层蛋白结合的区域。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.03.742457v1?rss=1

🏷️ LAP2α缺失 A型核纤层蛋白 染色质重组 染色质可及性 基因表达调控 染色质重塑因子