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背景:哮喘加重是由气道细胞群与免疫细胞群之间失调的细胞相互作用所导致的。循环微小RNA(microRNA,miRNA)是哮喘加重的潜在生物标志物;然而,其靶向的气道细胞仍缺乏明确界定。 目的:识别受与哮喘加重相关的循环miRNA调控的细胞类型,并确定这些细胞受miRNA调控的程度。 方法:我们将一个经整理的、与加重相关的循环miRNA面板,与来自16例哮喘患者和8名健康对照者诱导痰液的单细胞RNA测序(scRNA-seq)谱进行整合。将经实验验证的miRNA-靶基因相互作用与细胞类型特异性差异表达相结合。采用Elastic Net回归和SHAP分析量化基因水平的调控贡献,从而得到一个综合性的调控强度指标。研究结果在4个独立的GEO数据集中进行了验证。 结果:包括单核细胞、树突状细胞和巨噬细胞在内的免疫细胞表现出最强且具有统计学显著性的miRNA调控信号,这与气道上皮细胞形成对比。hsa-miR-222-3p在成熟巨噬细胞与肺泡巨噬细胞中表现出相反的调控效应,提示其活性依赖于分化状态;而B_Plasma细胞在所检测的任何miRNA中均未显示出可检测到的调控效应。独立的GEO验证证实,健康个体中保护性miRNA(hsa-miR-126-3p、hsa-miR-146b-5p)的表达更高,这与既往CAMP队列研究中的相关性结果一致。 结论:循环miRNA表现出细胞类型特异性的调控活性,其中以单核细胞、树突状细胞和巨噬细胞中最强。hsa-miR-222-3p在不同巨噬细胞亚型之间显示出相反的调控方向,而B_Plasma细胞未显示出调控效应;这一结果已在独立的GEO队列中得到验证。
背景:哮喘急性加重由气道细胞群与免疫细胞群之间失调的细胞相互作用所致。循环微小RNA(miRNA)是哮喘急性加重的潜在生物标志物;然而,其靶向的气道细胞仍未得到充分界定。
目的:识别受与哮喘急性加重相关的循环微小RNA调控的细胞类型,以及这些细胞受miRNA调控的程度。
方法:我们将一组经整理的、与急性加重相关的循环miRNA面板,与来自16例哮喘患者和8名健康对照者诱导痰液的单细胞RNA测序(scRNA-seq)谱进行整合分析。将经实验验证的miRNA-靶基因相互作用与细胞类型特异性差异表达相结合。采用弹性网络回归和SHAP分析量化基因水平的调控贡献,从而得到综合性“调控强度”指标。研究结果在4个独立的GEO数据集中进行了验证。
结果:免疫细胞,包括单核细胞、树突状细胞和巨噬细胞,显示出最强且具有统计学显著性的miRNA调控信号,这与气道上皮细胞形成对比。hsa-miR-222-3p在成熟巨噬细胞与肺泡巨噬细胞中表现出相反的调控效应,提示其活性依赖于分化状态;而B_Plasma细胞对所检测的任何miRNA均未显示出可检测的调控效应。独立GEO数据验证证实,健康个体中保护性miRNA(hsa-miR-126-3p、hsa-miR-146b-5p)的表达更高,这与既往CAMP队列中的相关结果一致。
结论:循环miRNA表现出细胞类型特异性的调控活性,其中以单核细胞、树突状细胞和巨噬细胞中的作用最强。hsa-miR-222-3p在不同巨噬细胞亚型之间呈现相反的调控方向,而B_Plasma细胞未显示出调控效应;上述结果已在独立GEO队列中得到验证。
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📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.31.741637v1?rss=1
🏷️ 哮喘急性加重 单细胞转录组 miRNA调控 免疫细胞 巨噬细胞 生物标志物