G4All：实验验证的G-四链体形成序列数据库

G-四链体（G4）是非经典核酸结构，在基因调控、基因组稳定性和疾病中发挥关键作用，因此成为治疗和生物技术应用的重要靶标。然而，目前缺乏一个经过整理的、集中式的、经实验验证的短序列（主要为合成序列）G4形成序列数据库，并且这些序列与适当的单链或发夹结构对照序列相配对，这限制了研究结果的可重复性并阻碍了该领域的发展。 在此，我们介绍 G4All，这是一个全面整理的 G4 形成短 DNA 和 RNA 序列数据库，并辅以经过严格筛选的非 G4 对照序列；所有序列均在大致相似的实验条件下进行研究（约 100 mM 钾离子、接近中性的 pH）。G4All 整合了通过多种实验方法验证的序列，包括圆二色性、核磁共振和紫外光谱，并对拓扑结构、热稳定性和实验条件进行了标准化注释。通过同时提供正样本和负样本数据集，G4All 能够支持严格的比较分析、实验检测基准评估以及预测模型的开发。该数据库支持广泛的应用场景，从 G4 生物物理学的基础研究到适配体的理性设计，以及预测算法的基准测试。未来，G4All 将进一步扩展，以纳入用户提交的数据集和更多 RNA 序列。作为一个可自由访问的资源，G4All 提供可检索的界面和可下载的数据集，建立了一个由社区驱动的枢纽，以加速 G4 研究中的发现与标准化进程。

G-四链体（G4）是非经典核酸结构，在基因调控、基因组稳定性和疾病中具有关键作用，因此成为治疗和生物技术应用中的重要靶标。然而，由于缺乏一个经过整理、集中且经实验验证的短序列（主要为合成序列）G4形成序列数据库，并配有合适的单链或发夹对照，这一领域的可重复性受到限制，研究进展也因此受阻。本文介绍了 G4All，这是一个全面整理的 G4 形成短 DNA 和 RNA 序列数据库，并辅以严格筛选的非 G4 对照；所有序列均在大致相似的实验条件下进行研究（约 100 mM 钾离子、接近中性的 pH）。G4All 整合了通过多种实验方法验证的序列，包括圆二色性、核磁共振和紫外光谱，并对其拓扑结构、热稳定性和实验条件进行了标准化注释。通过同时提供阳性和阴性数据集，G4All 能够支持严格的比较分析、实验测定基准测试以及预测模型的开发。该数据库支持广泛的应用范围，从 G4 生物物理学基础研究到适配体的理性设计，以及预测算法的基准评估。未来的发展将把 G4All 扩展为纳入用户提交的数据集和更多 RNA 序列。G4All 可免费访问，提供可检索界面和可下载数据集，正在建立一个由社区驱动的枢纽，以加速 G4 研究中的发现与标准化。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.05.743020v1?rss=1

🏷️ G-四链体 实验验证 序列数据库 DNA/RNA结构 对照序列 数据标准化