沿着微生物组之树追根溯源：母体产后及幼崽早期定植动态的多部位表征

生命早期的微生物定植对于塑造宿主发育至关重要，然而，不同母体微生物储库如何促成子代不同身体部位的定植，仍然知之甚少。在本研究中，我们探讨了幼犬出生后第一周内口腔和直肠微生物群的定植与成熟过程，并评估了母体口腔、阴道、直肠及乳汁微生物群对早期定植的贡献。我们于产后第1天和第8天，从33只母犬及其窝仔中采集了505份样本，并利用16S rRNA基因测序对微生物群落进行了表征。我们发现，幼犬在第1天的口腔微生物组与母体乳汁和阴道微生物群高度相似。相比之下，幼犬直肠微生物组在初期与所有母体身体部位的微生物群均存在明显差异，这提示其定植还可能受到其他未测量来源的贡献。到第8天时，口腔和直肠微生物组均表现出早期成熟的迹象，机会性类群的相对丰度下降，同时与母体微生物特征的相似性增加。在母犬中，阴道微生物组显示出产后幅度最大的变化，而直肠微生物组也表现出较小但显著的变化，乳汁和口腔微生物组则保持稳定。我们的结果表明，母体对早期微生物组组装的贡献具有身体部位特异性，且在生命第一周内，口腔和直肠微生物组遵循不同的发育轨迹，这与一种由母体来源以及可能的额外非母体来源共同塑造的动态定植过程一致。所观察到的模式与人类研究中的报道相一致，支持犬作为比较模型，用于研究哺乳动物生命早期微生物组定植及母婴传播过程的价值。

生命早期的微生物定植对于塑造宿主发育至关重要，然而，不同母体微生物储库如何促进子代不同身体部位的定植，仍然知之甚少。在本研究中，我们探讨了幼犬出生后第一周内口腔和直肠微生物群的定植与成熟过程，并评估了母体口腔、阴道、直肠及乳汁微生物群对早期定植的贡献。我们于产后第1天和第8天，从33只母犬及其窝仔中采集了505份样本，并采用16S rRNA基因测序对微生物群落进行了表征。我们发现，幼犬在第1天的口腔微生物组与母体乳汁和阴道微生物群高度相似。相比之下，幼犬的直肠微生物组起初与所有母体身体部位的微生物群均存在明显差异，这提示还存在其他未测量来源的贡献。到第8天时，口腔和直肠微生物组均表现出早期成熟的迹象，机会性类群的相对丰度下降，同时与母体微生物特征的相似性增加。在母犬中，阴道微生物组在产后表现出最大幅度的变化，而直肠微生物组也出现了较小但显著的改变，乳汁和口腔微生物组则保持稳定。我们的结果揭示，母体对早期微生物组组装的贡献具有身体部位特异性，口腔和直肠微生物组在生命最初一周遵循不同的发育轨迹，这与一种由母体来源及可能的其他非母体来源共同塑造的动态定植过程相一致。所观察到的模式与人类研究中的报道相一致，支持犬作为比较模型在研究哺乳动物生命早期微生物组定植及母婴传播方面的价值。

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.04.742690v1?rss=1

🏷️ 早期微生物定植 母婴微生物传播 犬微生物组 16S rRNA测序 口腔与直肠微生物群