2,3,7,8-四氯二苯并对二噁英暴露小鼠肝脏RNA-Seq数据集中转录组宽松性的比较分析

root 提交于 周四, 08/06/2026 - 06:47
组学方法被设想用于补充化学品风险评估中的传统毒理学测试,其中识别不良效应是关键步骤。然而,转录组数据的高维性在历史上导致分析依赖于具体语境。Liberality 是一种可降低全基因组尺度数据维度的定量指标,其变化反映潜在的生物学现象。 在本研究中,我们测量了小鼠肝脏 RNA 测序(RNA-Seq)数据集中的 liberality,这些数据来自于小鼠每 4 天暴露于环境污染物 2,3,7,8-四氯二苯并对二噁英(TCDD)一次、持续 28 天或 92 天的研究,并比较了剂量—liberality 关系。28 天和 92 天的 TCDD 处理均提高了 liberality,但表现出不同的剂量—liberality 关系。对促成 liberality 的基因进行分析显示,较长的暴露持续时间诱导了转录组结构更为广泛的改变。这些发现表明,liberality 可作为一种无偏指标,用于评估处理诱导的转录组扰动程度。

组学方法一直被设想用于补充化学品风险评估中的传统毒理学检测,而识别不良效应是其中的关键步骤。然而,转录组数据的高维性在历史上导致其分析依赖于特定语境。Liberality是一种能够降低全基因组尺度数据维度的定量指标,其变化可反映潜在的生物学现象。

在本研究中,我们测定了小鼠肝脏RNA测序(RNA-Seq)数据集中的liberality,这些数据来自于小鼠每4天暴露于环境污染物2,3,7,8-四氯二苯并对二噁英(TCDD)一次、持续28天或92天的研究,并比较了剂量—liberality关系。28天和92天的TCDD处理均提高了liberality,但呈现出不同的剂量—liberality关系。对促成liberality变化的基因进行分析表明,较长的暴露持续时间诱导了转录组结构更为广泛的改变。这些发现提示,liberality可作为一种无偏倚指标,用于评估处理所诱导的转录组扰动程度。


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.30.741944v1?rss=1

🏷️ TCDD暴露 小鼠肝脏 RNA-seq 转录组扰动 毒理组学