跨越病毒蛋白质组的肽平铺筛选鉴定出应激诱导细胞死亡的模块化调控因子

root 提交于 周四, 08/06/2026 - 16:47
病毒广泛操纵宿主的应激与细胞死亡通路,以促进感染和持续存在,然而,介导这些效应的病毒蛋白内部区域仍缺乏明确界定。在本研究中,我们采用汇集肽段平铺方法,系统鉴定了能够改变细胞死亡的紧凑型病毒蛋白区域。我们对来源于192种人类病毒的1,659个病毒开放阅读框进行了肽段平铺,并鉴定出498条肽段,这些肽段可保护U2OS细胞免受p53激动剂RITA(p53再激活与肿瘤细胞凋亡诱导剂)处理的影响,或使其对该处理敏感。活性肽段并不共享共同的结构特性,但富集了与信号传导、转运和应激调控相关的短线性基序。功能验证和转录组分析表明,保护性肽段能够广泛重塑宿主中涉及应激反应、细胞凋亡、RNA代谢和细胞生长的通路。对来源于HSV-2 VP11/12和KSHV主要衣壳蛋白ORF25的肽段进行分析,揭示了先前未被认识到的区域,这些区域在功能上不同于其母体蛋白的经典活性。这些发现支持这样一种模型:病毒蛋白编码模块化的宿主调控功能,并确立了肽段平铺作为一种可扩展框架,用于跨病毒蛋白质组开展功能注释。

病毒广泛操纵宿主的应激与细胞死亡通路以促进感染和持续存在,然而,介导这些效应的病毒蛋白内部区域仍缺乏明确定义。在本研究中,我们采用汇集肽段平铺方法,系统鉴定能够改变细胞死亡的紧凑型病毒蛋白区域。我们对来自192种人类病毒的1,659个病毒开放阅读框进行了平铺,鉴定出498条肽段,这些肽段可使U2OS细胞在接受p53激动剂RITA(p53再激活与肿瘤细胞凋亡诱导剂)处理时产生保护作用或敏化作用。活性肽段并不共享共同的结构特性,但其所含短线性基序显著富集,这些基序与信号传导、转运及应激调控相关。功能验证和转录组分析表明,保护性肽段可广泛重塑宿主中涉及应激反应、细胞凋亡、RNA代谢和细胞生长的通路。对来源于HSV-2 VP11/12和KSHV主要衣壳蛋白ORF25的肽段分析揭示了此前未被认识到的区域,这些区域在功能上不同于其母体蛋白的经典活性。这些发现支持这样一种模型:病毒蛋白编码了模块化的宿主调控功能,并确立了肽段平铺作为一种可扩展框架,可用于跨病毒蛋白质组的功能注释。


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.04.742754v1?rss=1

🏷️ 病毒蛋白质组 肽段平铺筛选 细胞死亡调控 宿主应激反应 短线性基序 功能注释