内含子编码了一大类Kink-loop RNA，可对前体mRNA剪接进行自我调控

内含子占据了人类基因组近三分之一的区域，然而，它们是否编码广泛存在的调控功能仍不清楚。本文鉴定出一类广泛存在的、来源于内含子的 kink-loop RNA（klRNA），其可在局部调控前体 mRNA 的加工。通过互补性的富集策略，我们在人类和小鼠中分别发现了约 15,200 个和 3,500 个此前未被注释的 klRNA。klRNA 由保守的 RNA 结合蛋白 15.5K 结合，构成一类独特的结构化 RNA 家族；它们主要来源于内含子，缺乏 Kink-turn 基序的经典茎部结构，并且不与已知非编码 RNA 表现出反义互补性。15.5K 的耗减会破坏 klRNA 的生物发生，并导致其在全局范围内丢失。全转录组分析表明，klRNA 主要以顺式方式发挥功能，以依赖 kink-loop 结构的方式抑制其宿主内含子的切除，从而使内含子能够调控其自身的加工。综上，我们的研究确立了由 RNA 结构编码的自我调控是一种广泛存在的、控制内含子命运的机制，并揭示了内含子是调控性 RNA 的活跃来源。

李斌

教育部基因功能与调控重点实验室、生物防治国家重点实验室、广东省药用功能基因重点实验室、进化合成生物学中心，中山大学，广东广州，中国

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发布于 2026 年 8 月 4 日。

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内含子编码一大类可自我调控前体 mRNA 剪接的 Kink-loop RNA

斌 李 ， 乔 林 ， 安睿 刘 ， 昊飞 甘 ， 淑蓉 刘 ， 武健 郑 ， 永林 梁 ， 刚 万 ， 良虎 瞿 ， 建华 杨

bioRxiv

2026.08.03.742641；

doi：

https://doi.org/10.64898/2026.08.03.742641

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内含子编码一大类可自我调控前体 mRNA 剪接的 Kink-loop RNA

斌 李 ， 乔 林 ， 安睿 刘 ， 昊飞 甘 ， 淑蓉 刘 ， 武健 郑 ， 永林 梁 ， 刚 万 ， 良虎 瞿 ， 建华 杨

bioRxiv

2026.08.03.742641；

doi：

https://doi.org/10.64898/2026.08.03.742641

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.03.742641v1?rss=1

🏷️ 内含子 RNA结构 前体mRNA剪接 自我调控 kink-loop RNA 非编码RNA