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抗菌肽(AMPs)在对抗耐药病原体方面展现出巨大前景,然而,当前的设计模型并未明确考虑其主要作用机制——膜破坏。为弥补这一空白,我们提出了AMPainterV2,这是一种利用生成对抗模仿学习设计膜裂解型抗菌肽的模型。AMPainterV2整合了混合专家(Mixture-of-Experts,MoE)策略网络,以支持插入、删除和突变操作,从而扩展了进化设计空间。 体外实验表明,从随机序列进化得到的排名前十的肽全部为具有活性的膜裂解型抗菌肽,其中最佳候选肽的平均最低抑菌浓度(MIC)达到1.5 M,且其膜裂解活性优于多黏菌素B。特别是,AMPainterV2的仅删除版本能够实现膜裂解型抗菌肽的小型化,获得了六条小型化肽,其活性相当或有所提升,同时平均长度缩短了36%。总体而言,AMPainterV2推动了机制驱动的抗菌肽设计,并为抗菌肽的低成本开发提供了有价值的工具。
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🏷️ 抗菌肽设计 膜裂解机制 混合专家模型 生成对抗模仿学习 进化设计 耐药病原体
来源出处
基于混合专家模型的膜裂解型抗菌肽进化设计
https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.29.741660v1?rss=1