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蛋白质丰度的调控使真菌能够适应变化的环境，调节其生长和形态，并对外界胁迫作出反应。Ssd1是一种真菌RNA结合蛋白，能够结合编码细胞壁重塑蛋白的mRNA，并调控细胞壁生物发生。通过计算和生化分析已对Ssd1结合位点（SBS）进行了描述，但Ssd1如何识别这些位点，以及这种识别如何与蛋白质丰度调控相关，仍不甚明确。在本研究中，酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）Ssd1与SBS的共晶结构揭示了识别作用的核心决定因素；同时，研究使用受Ssd1调控的细胞壁蛋白Sun4的荧光报告系统，对结构指导下设计的突变体进行了表征。 我们发现，Ssd1具有广泛的RNA结合界面，可识别SBS的两个元件：一个形成结构基序的上游元件，以及一个含有串联CNYU序列、通过碱基特异性识别与Ssd1相互作用的元件。对Ssd1 RNA结合表面的突变会阻断Ssd1依赖性的荧光报告抑制，并在细胞壁胁迫抗性检测以及与Cbk1激酶的遗传互作分析中表现出显著表型。如果同时改变SUN4的两个SBS，也会观察到抑制作用的丧失。然而，SUN4的5'非翻译区中仅存在一个SBS，就足以赋予蛋白质丰度的Ssd1依赖性抑制。我们的研究证实，RNA结合是Ssd1的核心功能，并且这一发现很可能有助于阐明酿酒酵母以外真菌中的功能分析；在这些真菌中，Ssd1同源蛋白已被鉴定为多种真菌病原体的毒力因子。
真菌RNA结合蛋白Ssd1通过识别5′ UTR的结构与序列元件抑制Sun4蛋白丰度 | bioRxiv
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真菌RNA结合蛋白Ssd1通过识别5′ UTR的结构与序列元件抑制Sun4蛋白丰度
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Atlanta G Cook
doi： https://doi.org/10.64898/2026.08.03.741543
Benjamin Kleinerman 爱丁堡大学
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发布于 2026 年 8 月 4 日。
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真菌RNA结合蛋白Ssd1通过识别5′ UTR的结构与序列元件抑制Sun4蛋白丰度
Benjamin Kleinerman， Uma Jayachandran， Marah Jnied， Weronika Danecka， Aleksandra Rosinska， Edward Wallace， Atlanta G Cook
bioRxiv 2026.08.03.741543； doi： https://doi.org/10.64898/2026.08.03.741543
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真菌RNA结合蛋白Ssd1通过识别5′ UTR的结构与序列元件抑制Sun4蛋白丰度
Benjamin Kleinerman， Uma Jayachandran， Marah Jnied， Weronika Danecka， Aleksandra Rosinska， Edward Wallace， Atlanta G Cook
bioRxiv 2026.08.03.741543； doi： https://doi.org/10.64898/2026.08.03.741543
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.03.741543v1?rss=1
🏷️ 真菌RNA结合蛋白 5'UTR识别 Ssd1 Sun4 蛋白质丰度调控 细胞壁生物发生