位于置换链上的体积庞大损伤促进二聚体UvrD家族解旋酶对DNA的解旋

root 提交于 周二, 08/04/2026 - 18:47
UvrD家族SF1A解旋酶在DNA代谢中发挥多种生物学作用,包括复制、重组、DNA修复以及接合质粒转移。该家族的特征在于其亚结构域构型,由两个RecA马达亚结构域(1A和2A)组成,且每个亚结构域均含有一个辅助性的B结构域插入片段(1B和2B)。单体UvrD家族酶具有ATP酶活性和3'-5'单链DNA转位酶活性,但不具有解旋酶活性。通过2B-2B结构域界面形成的酶二聚体则表现为过程性的DNA解旋酶。对此现象的一种部分解释是,基于单体和二聚体DNA结合复合物之间的结构比较,二聚化消除了2B结构域与双链DNA之间的抑制性接触,从而激活了解旋酶活性。然而,生物化学观察揭示了二聚体机制的其他方面,这些方面不能仅由2B亚结构域的移动来解释。在此,我们提出数据表明,结核分枝杆菌UvrD1二聚体与双链中被置换的链发生相互作用(即在解旋方向上的5'-3'链)。特别是,被置换链上的大体积损伤——包括胸腺嘧啶二聚体——在一定范围的双链长度内导致了更高效的解旋。这些发现提示了UvrD家族二聚体解旋的一种模型:其中一个亚基与被置换链形成紧密接触,而这种相互作用促进了二聚体所特有的过程性DNA解旋。

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置换链上的大体积损伤促进二聚体UvrD家族解旋酶的DNA解旋

Eric Tomko,Ankita Chadda,Eric Galburt

doi: https://doi.org/10.64898/2026.08.03.742518

Eric Tomko 圣路易斯华盛顿大学 在 Google Scholar 上查找此作者 在 PubMed 上查找此作者 在持有人为作者/资助方,其已授予bioRxiv永久展示该预印本的许可。 本文依据 CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可协议提供。

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发表于 2026年8月3日。

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置换链上的大体积损伤促进二聚体UvrD家族解旋酶的DNA解旋

Eric Tomko, Ankita Chadda, Eric Galburt

bioRxiv 2026.08.03.742518; doi: https://doi.org/10.64898/2026.08.03.742518

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置换链上的大体积损伤促进二聚体UvrD家族解旋酶的DNA解旋

Eric Tomko, Ankita Chadda, Eric Galburt

bioRxiv 2026.08.03.742518; doi: https://doi.org/10.64898/2026.08.03.742518


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.03.742518v1?rss=1

🏷️ UvrD解旋酶 DNA解旋 二聚体机制 DNA损伤 胸腺嘧啶二聚体 结核分枝杆菌