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大多数胰腺导管腺癌（PDAC）的单细胞与空间研究仅分析单一队列或平台，从而掩盖了可重复出现的生物学规律。我们整合了一个人类胰腺单细胞与单核参考图谱，包含来自19项研究的1,186,130个细胞，并对176个Visium切片进行了诠释，这些切片共包含458,877个点位，覆盖非疾病胰腺、慢性胰腺炎、PanIN、IPMN、原发性PDAC及转移灶。在两种基于RNA的拷贝数变异推断方法未能正确识别已知二倍体对照后，我们采用了有标志物支持的标签注释。BANKSY结构域、两种参考映射方法以及样本水平分析共同解析出一条横断面的上皮轴线，该轴线从富含腺泡细胞的组织延伸至恶性组织。五种轨迹算法在共享嵌入空间上恢复出相似的排序；其共识被解释为与转化相关，而非时间性或克隆性。恶性区域在整体上与成纤维细胞和髓系细胞区室相分离。有符号距离分析将这一模式进一步细化为恶性核心、始于肿瘤边界的CAF/髓系包绕层，以及更远端的淋巴样区室。以COLLAGEN、LAMININ和FN1为主导的候选细胞外基质通讯集中于界面区域。在6对患者匹配的正常—肿瘤样本中，采用精确的患者水平检验重现了这些变化。Visium HD在单细胞分辨率下解析出相同的组织结构，并显示8微米分箱会扭曲免疫邻接性的估计。Xenium同样揭示了反复出现的邻域结构，但其基质边界具有样本特异性。我们提供了一个可感知混杂因素的框架，用于识别PDAC中可重复出现的上皮及微环境组织结构。
人胰腺的单细胞与多平台空间图谱解析了与转化相关的上皮轴以及反复出现的边界组织化肿瘤微环境 | bioRxiv
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人胰腺的单细胞与多平台空间图谱解析了与转化相关的上皮轴以及反复出现的边界组织化肿瘤微环境
Kaili Liu， Hua Zhong， Rahhul S. Elangovan， Yuanhong Sun， Lin Wang， Abigae P. Williams， Trisha I. Valerio， Coline Furrer， Jacob P. Adams， Ashley R. Hoover， Wei R. Chen
doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.31.742073
Kaili Liu 美国俄克拉荷马州诺曼市，俄克拉荷马大学 Stephenson 生物医学工程学院
Hua Zhong 美国俄克拉荷马州诺曼市，俄克拉荷马大学 Stephenson 生物医学工程学院
Rahhul S. Elangovan 美国俄克拉荷马州诺曼市，俄克拉荷马大学 Stephenson 生物医学工程学院
Rahhul S. Elangovan 的 ORCID 记录
Yuanhong Sun 美国俄克拉荷马州诺曼市，俄克拉荷马大学 Stephenson 生物医学工程学院
Lin Wang 美国俄克拉荷马州诺曼市，俄克拉荷马大学 Stephenson 生物医学工程学院
Abigae P. Williams 美国俄克拉荷马州诺曼市，俄克拉荷马大学 Stephenson 生物医学工程学院
Trisha I. Valerio 美国俄克拉荷马州诺曼市，俄克拉荷马大学 Stephenson 生物医学工程学院
Coline Furrer 美国俄克拉荷马州诺曼市，俄克拉荷马大学 Stephenson 生物医学工程学院
Jacob P. Adams 美国俄克拉荷马州诺曼市，俄克拉荷马大学 Stephenson 生物医学工程学院
Ashley R. Hoover 美国俄克拉荷马州诺曼市，俄克拉荷马大学 Stephenson 生物医学工程学院
Wei R. Chen 美国俄克拉荷马州诺曼市，俄克拉荷马大学 Stephenson 生物医学工程学院
Wei R. Chen 的 ORCID 记录
通讯请联系： wei-r-chen{at}ou.edu
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摘要
大多数胰腺导管腺癌（PDAC）的单细胞与空间研究仅分析单一队列或单一平台，从而掩盖了反复出现的生物学规律。我们整合了来自 19 项研究的人胰腺单细胞与单核参考图谱，共计 1,186,130 个细胞，并对 176 个 Visium 切片中的 458,877 个 spot 进行了解析，这些样持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本文依据 CC-BY 4.0 国际许可协议公开提供。
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发布于 2026 年 8 月 3 日。
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Kaili Liu， Hua Zhong， Rahhul S. Elangovan， Yuanhong Sun， Lin Wang， Abigae P. Williams， Trisha I. Valerio， Coline Furrer， Jacob P. Adams， Ashley R. Hoover， Wei R. Chen
bioRxiv 2026.07.31.742073； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.31.742073
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人胰腺的单细胞与多平台空间图谱解析了与转化相关的上皮轴以及反复出现的边界组织化肿瘤微环境
Kaili Liu， Hua Zhong， Rahhul S. Elangovan， Yuanhong Sun， Lin Wang， Abigae P. Williams， Trisha I. Valerio， Coline Furrer， Jacob P. Adams， Ashley R. Hoover， Wei R. Chen
bioRxiv 2026.07.31.742073； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.31.742073
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.31.742073v1?rss=1
🏷️ 胰腺导管腺癌 单细胞转录组 空间转录组 肿瘤微环境 上皮转化轴 细胞外基质