Xpo1依赖性NES的序列空间揭示了功能亲和力上限

Exportin 1（Xpo1/Crm1）可将数百种蛋白质从细胞核输出至细胞质。它识别含有4–5个疏水性{varphi}残基、且这些残基之间由间隔残基分隔的核输出信号（NES）。在本研究中，我们通过对Xpo1结合进行高通量比率计分，结合噬菌体展示与深度测序，探索了最常见NES类别的序列空间。由此获得了一个位置偏好图谱，并揭示不仅是{varphi}位点，而且间隔残基和侧翼残基对NES活性也至关重要。 我们在体内对这些数据进行了验证，并采用了一种新的平衡亲和力测量方法；该方法利用了当NES{middle dot}Xpo1{middle dot}RanGTP复合物分配进入FG相时对Xpo1的竞争。以这些偏好为指导，我们设计了满足既有NES共识序列、却不能赋予输出功能的肽。相反，我们还改造出了以低皮摩尔亲和力结合Xpo1的NES，这一点可由晶体结构加以解释。然而，这类极端强结合体将不再从Xpo1上释放，并以反式方式阻断输出，这也解释了为何天然NES的亲和力始终保持在适中水平。我们的数据为NES及其他基于肽的信号的预测、鉴定与工程化设计提供了一个框架。

在持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。

本文依据 CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可协议 提供。

返回顶部

上一页

下一页

发布于 2026 年 8 月 3 日。

下载 PDF

电子邮件

您的电子邮件

*

您的姓名

*

发送至

*

请输入多个地址，每行一个，或用逗号分隔。

您将通过电子邮件发送以下内容

Xpo1 依赖性 NES 的序列空间揭示功能性亲和力上限

邮件主题

（您的姓名）已从 bioRxiv 转发一个页面给您

邮件正文

（您的姓名）认为您可能希望查看 bioRxiv 网站上的此页面。

您的个性化留言

验证码

此问题用于测试您是否为人工访客，并防止自动化垃圾信息提交。

分享

Xpo1 依赖性 NES 的序列空间揭示功能性亲和力上限

Dirk Görlich， Oleh Rymarenko， Trevor Huyton

bioRxiv 2026.07.31.742000； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.31.742000

分享本文：

复制

引文工具

Xpo1 依赖性 NES 的序列空间揭示功能性亲和力上限

Dirk Görlich， Oleh Rymarenko， Trevor Huyton

bioRxiv 2026.07.31.742000； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.31.742000

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.31.742000v1?rss=1

🏷️ 核输出信号 Xpo1/Crm1 蛋白质核质转运 序列-功能关系 结合亲和力 高通量测序