咖啡通过降低MYC启动子处的H3K27ac水平重塑全局组蛋白乙酰化景观

咖啡摄入与多种慢性疾病（包括癌症）风险降低相关；然而，咖啡是否调控表观遗传图谱在很大程度上仍不清楚。在此，我们表明咖啡可在人类细胞中广泛重塑组蛋白乙酰化图谱。定量组蛋白修饰蛋白质组学显示，咖啡处理后活性组蛋白乙酰化标记在全局范围内降低。从机制上看，咖啡降低了组蛋白乙酰转移酶GCN5和MOF的丰度，减少了14-3-3蛋白，促进了II类组蛋白去乙酰化酶在细胞核内的积累，并诱导组蛋白低乙酰化；这种低乙酰化可被组蛋白去乙酰化酶抑制剂曲古抑菌素A逆转。全基因组H3K27ac图谱分析显示，启动子和增强子的乙酰化广泛丧失，并伴随着广泛的转录重编程。对ChIP-seq、RNA-seq、蛋白质组学及生化验证的整合分析一致表明，MYC转录程序受到抑制，具体表现为MYC表达降低、MYC靶基因启动子处H3K27ac减少、经典MYC靶基因下调以及MYC靶基因特征减弱。在功能上，咖啡抑制了癌细胞增殖，而细胞死亡极少。总之，我们的研究结果表明，整体咖啡是一种此前未被认识的表观遗传调节因子，可通过重塑组蛋白乙酰化图谱并伴随抑制MYC转录程序发挥作用，这为理解咖啡抗肿瘤效应背后的表观遗传学基础提供了分子框架。

咖啡摄入与多种慢性疾病（包括癌症）风险降低相关；然而，咖啡是否调控表观遗传图谱在很大程度上仍不清楚。在此，我们表明，咖啡可在人类细胞中广泛重塑组蛋白乙酰化图谱。定量组蛋白修饰蛋白质组学分析显示，咖啡处理后活性组蛋白乙酰化标记在全局范围内减少。从机制上看，咖啡降低了组蛋白乙酰转移酶GCN5和MOF的丰度，减少了14-3-3蛋白，促进了II类组蛋白去乙酰化酶在细胞核内的积累，并诱导组蛋白低乙酰化；这种低乙酰化可被组蛋白去乙酰化酶抑制剂曲古抑菌素A逆转。全基因组H3K27ac谱分析显示，启动子和增强子乙酰化广泛丧失，并伴随广泛的转录重编程。对ChIP-seq、RNA-seq、蛋白质组学及生化验证的整合分析一致表明，MYC转录程序受到抑制，具体表现为MYC表达降低、MYC靶基因启动子处H3K27ac减少、经典MYC靶基因下调以及MYC靶基因特征减弱。从功能上看，咖啡抑制了癌细胞增殖，而仅引起极少的细胞死亡。总之，我们的研究结果揭示，整体咖啡是一种此前未被认识的表观遗传调节因子，能够通过重塑组蛋白乙酰化图谱并伴随MYC转录程序的抑制而发挥作用，这为理解咖啡抗肿瘤效应背后的表观遗传学基础提供了分子层面的框架。

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📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.01.742200v1?rss=1

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