- 4 次围观
环状 AAA+（与多种细胞活动相关的 ATP 酶）生物分子机器介导蛋白质重塑，以支持广泛的关键细胞功能。其依赖核苷酸的重塑作用涉及环内与环间的变构通讯，从而产生机械力，并通过一组伸入中央通道的环施加到其底物之上。在本研究中，我们通过比较研究探讨这些变构机制，研究对象包括 katanin（一种微管切割蛋白，含有一个第 3 类 AAA 结构域）以及双环 ClpB（一种蛋白质去聚集酶，同时含有第 3 类和第 5 类 AAA 结构域）。我们的分子动力学模拟结合机器学习和生物信息学分析，揭示了既有涉及第 3 类结构域的相似机制，也有涉及与第 5 类结构域通讯的 ClpB 特异性机制。我们发现，核苷酸和底物多肽的结合都会限制 katanin 和 ClpB 所采样的构象空间，而在后者中还观察到了配体特异性的构象。通过机器学习方法中的 SHapley Additive exPlanations 分析对次级结构元件的变构贡献进行排序，并结合对配体状态特征的二元分类，结果突出了邻近核苷酸结合位点区域和孔环的重要作用。对变构通路进行氨基酸水平分析表明，环内协同性调控了 AAA+ 原聚体内部的长程通讯。
用于微管切割与蛋白质解聚集的 AAA+ ATP 酶中变构调控机制的探究 | bioRxiv
跳转至主要内容
首页 关于 投稿 提醒 / RSS
搜索此关键词
高级搜索
新结果
用于微管切割与蛋白质解聚集的 AAA+ ATP 酶中变构调控机制的探究
Maryum Irshad， Krishan Walpalage， Zhaocheng Zhang， Maria S. Gillen， 查看 Ruxandra Ioana Dima 的 ORCID 主页， 查看 George Stan 的 ORCID 主页
doi： https://doi.org/10.64898/2026.08.01.742241
Maryum Irshad 辛辛那提大学 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本文依据 CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可协议发布。
返回顶部
上一篇
下一篇
发布于 2026 年 8 月 3 日。
下载 PDF
补充材料
电子邮件
感谢您有兴趣帮助传播 bioRxiv。
您的电子邮件 *
您的姓名 *
发送至 *
输入多个地址时，请分行填写或以逗号分隔。
您将通过电子邮件发送以下内容
用于微管切割与蛋白质解聚集的 AAA+ ATP 酶中变构调控机制的探究
邮件主题
（您的姓名）已从 bioRxiv 转发了一个页面给您
邮件正文
（您的姓名）认为您可能希望查看 bioRxiv 网站上的此页面。
您的个人留言
验证码
此问题用于测试您是否为人工访问者，并防止自动垃圾信息提交。
分享
用于微管切割与蛋白质解聚集的 AAA+ ATP 酶中变构调控机制的探究
Maryum Irshad， Krishan Walpalage， Zhaocheng Zhang， Maria S. Gillen， Ruxandra Ioana Dima， George Stan
bioRxiv 2026.08.01.742241； doi： https://doi.org/10.64898/2026.08.01.742241
分享本文：
复制
引文工具
用于微管切割与蛋白质解聚集的 AAA+ ATP 酶中变构调控机制的探究
Maryum Irshad， Krishan Walpalage， Zhaocheng Zhang， Maria S. Gillen， Ruxandra Ioana Dima， George Stan
bioRxiv 2026.08.01.742241； doi： https://doi.org/10.64898/2026.08.01.742241
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.01.742241v1?rss=1
🏷️ AAA+ ATP酶 变构调控 微管切断 蛋白质去聚集 分子动力学模拟 机器学习分析