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许多噬菌体利用尾刺降解宿主细菌的多糖,从而促进其接近外膜。沙门氏菌噬菌体 epsilon15 的同源三聚体尾刺具有一个细长的噬菌体结合结构域、一个折角,以及一个带有三个花瓣状突起的桶状区段。在此,我们报道了单独的单体突起花瓣结构域以及包含三个花瓣结构域的三聚体桶状区段的晶体结构。该桶状区段包含一个三聚体 β-螺旋——这是噬菌体尾刺的典型特征——以及一个三聚体 β-夹层结构域。花瓣结构域表现出丝氨酸-甘氨酸-天冬酰胺-组氨酸(SGNH)酯酶家族特征性的折叠。 与 O-抗原片段的共结晶鉴定出尾刺上的四个结合位点:两个位于三重 β-螺旋表面且彼此相邻的位点,一个位于 β-夹层结构域中,第四个位点位于花瓣酯酶位点附近。这些结合位点与噬菌体在 DNA 转移前瞬间的预期取向相一致。核磁共振波谱和定点诱变揭示了内切鼠李糖苷酶活性,表明该反应机制通过构型翻转进行,并显示活性位点位于两个 β-螺旋结合位点的交界处。类似的实验还揭示了花瓣结构域中的一个酯酶位点。综上,这些结构和功能方面的认识提示噬菌体 epsilon15 尾刺具有双重作用:对 O-抗原进行去乙酰化,这可能影响局部结构及脂多糖柔性;以及切割 O-抗原,从而使噬菌体能够接近细菌膜。
沙门氏菌噬菌体 epsilon15 尾刺的结构揭示了多个 O 抗原结合位点和一个突出的酯酶结构域 | bioRxiv
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沙门氏菌噬菌体 epsilon15 尾刺的结构揭示了多个 O 抗原结合位点和一个突出的酯酶结构域
Mateo Seoane-Blanco,Amaia Pereda,Nina Broeker,Michael McConnell,Francisco Javier Canhada,Stefanie Barbirz,Mark J. van Raaij
doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.31.742079
Mateo Seoane-Blanco 1 CNB-CSIC; 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方,其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本作品依据 CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可协议提供。
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发表于 2026 年 8 月 3 日。
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Mateo Seoane-Blanco,Amaia Pereda,Nina Broeker,Michael McConnell,Francisco Javier Canhada,Stefanie Barbirz,Mark J. van Raaij
bioRxiv 2026.07.31.742079; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.31.742079
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沙门氏菌噬菌体 epsilon15 尾刺的结构揭示了多个 O 抗原结合位点和一个突出的酯酶结构域
Mateo Seoane-Blanco,Amaia Pereda,Nina Broeker,Michael McConnell,Francisco Javier Canhada,Stefanie Barbirz,Mark J. van Raaij
bioRxiv 2026.07.31.742079; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.31.742079
📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.31.742079v1?rss=1
🏷️ 噬菌体尾刺蛋白 O抗原结合位点 SGNH酯酶结构域 沙门氏菌 晶体结构 多糖降解