酿酒酵母中RNA外切体基因EXOSC3/RRP40致病变异的系统比较揭示了变异特异性的功能后果

root 提交于 周一, 08/03/2026 - 20:47
RNA外切体是一种必需的、在进化上高度保守的核糖核酸酶复合物,负责多类RNA的加工与降解。该复合物由三个结构性帽部亚基(EXOSC1-3/Csl4、Rrp4、Rrp40;分别对应智人/酿酒酵母命名)、六个结构性核心亚基(EXOSC4-9/Rrp41、Rrp46、Mtr3、Rrp42、Rrp43、Rrp45)以及一个具有催化活性的核糖核酸酶亚基(DIS3或DIS3L/Dis3)组成。与RNA外切体结合的辅助因子赋予其底物特异性,使其能够靶向特定RNA进行加工和/或降解。编码RNA外切体结构亚基的基因中的错义突变已被证实与神经系统疾病相关。值得注意的是,已在EXOSC3中鉴定出多种致病性突变,并与1b型脑桥小脑发育不全(PCH1b)相关。这些致病等位基因导致了广泛的临床严重程度谱系,提示不同变体具有特异性的功能后果。鉴于人类与出芽酵母RNA外切体复合物之间具有高度保守性,我们对在出芽酵母Rrp40中建模的八种致病性EXOSC3变体进行了系统分析。我们发现,其中两种Rrp40变体会引起生长缺陷,与RNA外切体辅助因子突变体表现出不同的负遗传相互作用,并损害出芽酵母中的RNA加工。其中一种变体,即EXOSC3-Y109N/Rrp40-Y64N,此前尚未在任何机制研究中得到表征。计算稳定性预测和免疫印迹分析表明,大多数EXOSC3/Rrp40变体表现出降低的稳态蛋白水平,但蛋白水平的下降与表型或疾病严重程度并不严格相关,这提示不同变体可能通过不同机制破坏RNA外切体功能。总体而言,我们的研究表明,致病性EXOSC3变体通过不同机制改变RNA外切体功能,并为可能构成病理基础的特异性分子缺陷提供了见解。

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RNA外切体基因 EXOSC3/RRP40 致病变异在酿酒酵母中的系统比较揭示了变异特异性的功能后果

Milo B. Fasken, Sara W. Leung, Leonardo F. Serafim, Chunli Yan, Madison L. Intemann, Dustin L. Gable, Kristin W. Baranano, Ivaylo Ivanov, Homa Ghalei, Anita H. Corbett

doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.29.741578

Milo B. Fasken 1 埃默里大学;

Sara W. Leung 1 埃默里大学;

Leonardo F. Serafim 2 佐治亚州立大学;

Chunli Yan 2 佐治亚州立大学;

Madison L. Intemann 1 埃默里大学;

Dustin L. Gable 3 约翰斯·霍普金斯大学;

Kristin W. Baranano 3 约翰斯·霍普金斯大学;

Ivaylo Ivanov 4 佐治亚州立大学

Homa Ghalei 1 埃默里大学;

Anita H. Corbett 1 埃默里大学;

通讯作者: acorbe2{at}emory.edu

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摘要

RNA外切体是一种必需且在进化上保守的核糖核酸酶复合体,负责多类RNA的加工与降解。该复合体由三个结构性帽亚基(EXOSC1-3/Csl4、Rrp4、Rrp40;分别对应 H. sapiens/S. cerevisiae)、六个结构性核心亚基(EXOSC4-9/Rrp41、Rrp46、Mtr3、Rrp42、Rrp43、Rrp45)以及一个催化性核糖核酸酶(DIS3 或 DIS3L/Dis3)组成。与RNA外切体相关联的辅因子赋予其特异性,使其能够靶向特定RNA进行加工和/或降解。编码RNA外切体结构亚基的基因中的错义突变已被证实与神经系统疾病相关。值得注意的是,在 EXOSC3 中已鉴定出若干致病突变,这些突变与脑桥小脑发育不全1b型(PCH1b)相关。这些致病等位基因导致广泛的临床严重程度谱系,提示不同变异具有特异性的功能后果。鉴于人类与出芽酵母RNA外切体复合体之间具有高度保守性,我们对在出芽酵母Rrp40中建模的8种致病性 EXOSC3 变异进行了系统分析。我们发现其中两种Rrp40变异会导致生长缺陷,表现出与RNA外切体辅因子突变体不同的负向遗传相互作用,并损害出芽酵母中的RNA加工。其中一种变异 EXOSC3-Y109N/Rrp40-Y64N 先前尚未在任何机制研究中被表征。计算稳定性预测和免疫印迹分析表明,大多数 EXOSC3/Rrp40 变异表现出降低的稳态蛋白水平,但蛋白水平下降与表型或疾病严重程度并不严格相关,这提示个体变异可能通过不同机制破坏RNA外切体功能。总体而言,我们的研究表明,致病性 EXOSC3 变异通过不同机制改变RNA外切体功能,并为可能构成病理基础的特定分子缺陷提供了见解。

利益冲突声明

脚注

https://modelarchive.org/

已声明资助信息

美国国立卫生研究院,R35GM138123,R21AI193385,R35GM139382,R01ES032786,T32GM135060 INCITE 计划 美国能源部科学办公室用户设施,DE-AC05-00OR22725

版权

持有人为作者/资助方,其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本文依据 CC-BY-ND 4.0 国际许可协议公开提供。

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发表于 2026年8月2日。

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Milo B. Fasken, Sara W. Leung, Leonardo F. Serafim, Chunli Yan, Madison L. Intemann, Dustin L. Gable, Kristin W. Baranano, Ivaylo Ivanov, Homa Ghalei, Anita H. Corbett

bioRxiv 2026.07.29.741578; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.29.741578

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Milo B. Fasken, Sara W. Leung, Leonardo F. Serafim, Chunli Yan, Madison L. Intemann, Dustin L. Gable, Kristin W. Baranano, Ivaylo Ivanov, Homa Ghalei, Anita H. Corbett

bioRxiv 2026.07.29.741578; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.29.741578


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.29.741578v1?rss=1

🏷️ RNA外切体 EXOSC3/RRP40 致病变异 酿酒酵母模型 RNA加工 蛋白稳定性