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研究依据：肺癌是全球癌症相关死亡的首要原因，而在传统低风险人群中不断上升的发病率进一步凸显了改进早期检测方法的必要性，而下气道微生物组可能为此提供信息。 研究目的：评估呼吸道采样方法如何影响推断得到的微生物组结构，并检验支气管刷检是否能够恢复出一种在生态学上区别于支气管肺泡灌洗液（BAL）和口腔含漱液的微生物群落。 研究方法：本前瞻性队列纳入33名参与者（8例肺癌患者，25例非癌对照），分别接受口腔含漱、双侧支气管肺泡灌洗（BAL）和支气管刷检。通过小亚基核糖体rRNA基因扩增子序列变体（ASV）分析对微生物组结构进行表征，并采用指示种分析和SPIEC-EASI相关网络绘图来识别与样本类型或癌症状态相关的ASV。 测量指标和主要结果：采样方法是变异的主导轴。BAL群落与口腔含漱液高度相似（共有65个联合指示性ASV；而与刷检样本无一共享），而支气管刷检则产生了一个不同但低生物量的信号。在排除宿主来源序列后，鉴定出两个刷检特异性的指示性ASV，分别归属于鞘氨醇单胞菌科（Sphingomonadaceae）和一个未培养的类固醇杆菌科（Steroidobacteraceae），且二者在同一个共现模块中共定位。在该试点队列中未能检测到癌症状态效应，这与统计效能有限相一致。 结论：采样方法是决定推断所得呼吸道微生物组结构的主要因素。支气管刷检能够恢复一个不同但低生物量的信号，而当仅单独使用BAL时，该信号会被掩盖。然而，这一低生物量信号与宿主及污染物序列之间的重叠表明，要想有把握地解析出一个明确的下气道离散群落，仍需更深度的测序和专门的污染控制。这些方法学发现可直接为未来癌症及疾病关联研究的设计提供依据。
研究依据：肺癌是全球癌症相关死亡的首要原因，而在传统低风险人群中不断上升的发病率进一步凸显了改进早期检测方法的必要性；下呼吸道微生物组可能为此提供信息。研究目的：评估呼吸道取样方法如何影响推断的微生物组结构，并确定支气管刷检是否能够恢复出一个在生态学上区别于支气管肺泡灌洗液（BAL）和口腔含漱液的微生物群落。
研究方法：本前瞻性队列纳入33名参与者（8例肺癌患者，25例非癌对照），接受口腔含漱、双侧支气管肺泡灌洗（BAL）和支气管刷检。通过小亚基核糖体rRNA基因扩增子序列变体（ASV）分析对微生物组结构进行表征，并采用指示物种分析和SPIEC-EASI相关网络映射来识别与样本类型或癌症状态相关的ASV。
测量指标与主要结果：取样方法是变异的主导轴。BAL群落与口腔含漱液高度相似（65个共同指示性ASV；与刷检无共享ASV），而支气管刷检获得了一个不同但低生物量的信号。在排除宿主来源序列后，鉴定出两个刷检特异性的指示性ASV，分别归属于鞘氨醇单胞菌科（Sphingomonadaceae）和未培养的类固醇杆菌科（Steroidobacteraceae），且二者共定位于同一个共现模块内。在该试点队列中未检测到癌症状态效应，这与统计效能有限相一致。
结论：取样方法是决定推断呼吸道微生物组结构的主要因素。支气管刷检可恢复出一种不同但低生物量的信号，而当仅单独使用BAL时，该信号会被掩盖。然而，这一低生物量信号与宿主及污染物序列之间存在重叠，表明要可靠解析一个明确的下气道离散群落，仍需更深度测序和专门的污染控制。这些方法学发现为未来癌症及疾病相关性研究的设计提供了直接依据。
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.08.02.742334v1?rss=1
🏷️ 下呼吸道微生物组 采样方法 支气管肺泡灌洗 支气管刷检 16S rRNA扩增子测序 肺癌早筛