eBIC的3DED数据处理自动化|||北京沫之东生物技术有限公司

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三维电子衍射（3DED）是一项新兴且有用的技术，可用于从纳米尺度晶体中解析小分子和生物大分子的分子结构。我们介绍了在 Diamond Light Source 电子生物成像中心（eBIC）采集的 3DED 数据集的自动化数据处理工作流程。为此，我们开发了一个名为 AutoED 的软件包。该处理流程包括数据采集、束斑位置分析、元数据收集、文件转换，以及最终使用 xia2 进行数据处理（其同时支持 DIALS 和 XDS）。处理结果被记录在由 AutoED 生成的汇总报告中。我们的主要目标是减少电子衍射科学家的工作负担，同时推动采用大分子晶体学（MX）中已使用的良好规范。所有采集的 3DED 数据集都会被自动转换为 NeXus 数据格式，该格式被认为是 MX 领域的金标准。这种标准化的数据格式使得与实验相关的所有元数据能够与衍射图像一并保存。我们还讨论了 AutoED 中用于确定衍射图像上电子束位置的方法。

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三维电子衍射（3DED）是一种新兴且实用的技术，可用于利用纳米尺寸晶体解析小分子和生物大分子的分子结构。我们介绍了针对在 Diamond Light Source 电子生物成像中心（eBIC）采集的 3DED 数据集所开发的自动化数据处理工作流程。为此，我们开发了一个名为 AutoED 的软件包。该处理流程包括数据采集、束斑位置分析、元数据收集、文件转换，以及最终使用 xia2 进行数据处理（xia2 同时支持 DIALS 和 XDS）。处理结果由 AutoED 生成的汇总报告进行记录。我们的主要目标是减轻电子衍射科学家的工作负担，同时推动采用大分子晶体学（MX）中已经使用的良好标准。所有采集到的 3DED 数据集都会被自动转换为 NeXus 数据格式，该格式被认为是 MX 领域的金标准。这种标准化数据格式使得与实验相关的所有元数据都能够与衍射图像一并保存。我们还讨论了 AutoED 中用于确定衍射图像上电子束位置的方法。

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已声明的资助信息

Ada Lovelace Centre（ALC）

BBSRC

，BB/Y009991/1

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发布于 2026 年 8 月 1 日。

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