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抗微生物药物耐药性（AMR）是一种古老且自然存在的现象，但如今已对全球健康构成严重威胁。人类活动，尤其是畜牧业，通过创造富含粪肥的环境，促进了环境细菌与宿主相关细菌之间的相互作用，并推动了水平基因转移，从而塑造了微生物的进化。在本研究中，我们考察了芬兰图尔库发掘出的18世纪前工业化时期屠宰场周边环境中的休眠的潜在抗生素生产菌、微生物群落，以及其AMR基因和可移动遗传元件。通过结合培养方法、基因组分析、宏基因组测序和古DNA真实性鉴定方法，我们重建了前工业化时期的微生物组和耐药组，以更好地理解AMR早期生态与进化过程，并探究抗生素生产菌在AMR出现中的作用。 我们的结果揭示了若干仅在近期才被表征的耐药机制的推定祖先形式，例如磷霉素硫醇转移酶fosI、赋予对“最后防线”抗生素替加环素耐药性的质粒相关tmexCD-toprJ外排泵，以及与AMR基因可移动性相关的序列。这些发现表明，在抗生素被广泛使用之前，关键的AMR元件已经存在，反映出其长期的环境起源。
18世纪城市聚落与屠宰场环境中的抗生素抗性组与微生物群落 | bioRxiv
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18世纪城市聚落与屠宰场环境中的抗生素抗性组与微生物群落
查看 ORCID 个人资料 Minna Maria Maunula， 查看 ORCID 个人资料 Taru-Marja Makinen， Kari Uotila， 查看 ORCID 个人资料 Jenni Hultman， 查看 ORCID 个人资料 Kirill Bogdanov， 查看 ORCID 个人资料 Marko Virta， 查看 ORCID 个人资料 Johanna Muurinen
doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.31.742145
Minna Maria Maunula 1 赫尔辛基大学； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本文依据 CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可协议 进行发布。
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发布于 2026年7月31日。
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18世纪城市聚落与屠宰场环境中的抗生素抗性组与微生物群落 Minna Maria Maunula， Taru-Marja Makinen， Kari Uotila， Jenni Hultman， Kirill Bogdanov， Marko Virta， Johanna Muurinen bioRxiv 2026.07.31.742145； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.31.742145
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18世纪城市聚落与屠宰场环境中的抗生素抗性组与微生物群落 Minna Maria Maunula， Taru-Marja Makinen， Kari Uotila， Jenni Hultman， Kirill Bogdanov， Marko Virta， Johanna Muurinen bioRxiv 2026.07.31.742145； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.31.742145
📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.31.742145v1?rss=1
🏷️ 抗生素耐药性 宏基因组学 古DNA 微生物群落 水平基因转移 可移动遗传元件