人工整理的人类乳酰化组与蛋白质语言模型框架实现精准预测并揭示赖氨酸乳酰化的局部决定因素

root 提交于 周六, 08/01/2026 - 16:47
赖氨酸乳酰化是一种动态的翻译后修饰,能够改变蛋白质功能,并已被证明参与多种生理和病理过程。因此,准确鉴定乳酰化位点对于界定其调控图谱以及提出关于乳酰化相关机制的可检验假设至关重要。本文在此介绍CLEAR-Lactyl和AttentionKla。CLEAR-Lactyl是一个经人工整理的人类赖氨酸乳酰化基准数据集,包含16,604个阳性位点。AttentionKla是一个基于CLEAR-Lactyl训练的深度学习框架,采用了经LoRA微调的预训练蛋白质语言模型;其性能显著优于现有工具,并且通过全面的消融研究剖析了促成其性能提升的因素。其在预测新的乳酰化位点以及通过序列导向调控乳酰化水平方面的实用性,已在细胞实验中得到验证。总之,CLEAR-Lactyl和AttentionKla为赖氨酸乳酰化研究提供了一个强有力的平台,并为其他翻译后修饰的精准调控提供了一个可扩展的框架。

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经整理的人类赖氨酸乳酰化组与蛋白质语言模型框架实现精准预测并揭示赖氨酸乳酰化的局部决定因素

Zhengda Li,Youcheng Huang,Guangyao Shan,Di Zuo,Junhe Zhang,Yuqiang Du,Dejun Zeng,Xiliang Wang,Liang Chen,Hong Fan,Guangyu Yao

doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.28.741267

Zhengda Li 1 复旦大学附属中山医院胸外科,上海,200032,中国; 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方,其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 保留所有权利。未经许可不得转载使用。

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发布于 2026 年 7 月 31 日。

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Zhengda Li,Youcheng Huang,Guangyao Shan,Di Zuo,Junhe Zhang,Yuqiang Du,Dejun Zeng,Xiliang Wang,Liang Chen,Hong Fan,Guangyu Yao

bioRxiv 2026.07.28.741267; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.28.741267

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经整理的人类赖氨酸乳酰化组与蛋白质语言模型框架实现精准预测并揭示赖氨酸乳酰化的局部决定因素

Zhengda Li,Youcheng Huang,Guangyao Shan,Di Zuo,Junhe Zhang,Yuqiang Du,Dejun Zeng,Xiliang Wang,Liang Chen,Hong Fan,Guangyu Yao

bioRxiv 2026.07.28.741267; doi: https://doi.org/10.64898/2026.07.28.741267


📄 原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.28.741267v1?rss=1

🏷️ 赖氨酸乳酰化 翻译后修饰 蛋白质语言模型 深度学习预测 人工整理数据集