vOMIX-MEGA：一种用于太字节级病毒宏基因组学分析的超快速端到端流程

面向TB级宏基因组数据的病毒鉴定受限于可扩展性和计算资源。我们提出了vOMIX-MEGA，这是一种端到端的病毒宏基因组分析框架，通过在关键步骤中显著提升并行化能力和内存使用效率，克服了性能瓶颈。基于实证数据集的基准测试表明，该框架可在仅使用24 GB内存的情况下，最短于50分钟内完成处理，性能超过另外四种最先进的流程；后者分别需要7小时（383 GB）至14天（32 GB）不等。以模拟数据和实验数据进行基准评测时，vOMIX-MEGA的平均准确率分别高出21%和13%，其获取地址为 https://github.com/holab-hku/vOMIX-MEGA。

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vOMIX-MEGA：一种面向 TB 级病毒宏基因组学分析的超高速端到端流程。

Erfan SHEKARRIZ， Esla VIJENDRAN， Joshua W. K. Ho

doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.28.741255

Erfan SHEKARRIZ 香港大学 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本作品依据 CC-BY-NC 4.0 国际许可协议提供。

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发布于 2026 年 7 月 31 日。

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Erfan SHEKARRIZ， Esla VIJENDRAN， Joshua W. K. Ho

bioRxiv 2026.07.28.741255； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.28.741255

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vOMIX-MEGA：一种面向 TB 级病毒宏基因组学分析的超高速端到端流程。

Erfan SHEKARRIZ， Esla VIJENDRAN， Joshua W. K. Ho

bioRxiv 2026.07.28.741255； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.28.741255

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.28.741255v1?rss=1

🏷️ 病毒宏基因组学 端到端分析流程 高性能并行计算 TB级数据处理 病毒鉴定