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基因组和宏基因组测序改变了我们对感染真核微生物的大型DNA病毒多样性的认识。其中包括新近描述的感染变形虫的manesvirus，以及与海生网粘菌 Aurantiochytrium limacinum 相关的mirusvirus。利用长读长测序技术，我们组装了两种海生网粘菌的基因组，并发现了普遍存在的共培养病毒。研究发现，Schizochytrium aggregatum ATCC 28209 含有两种核质大DNA病毒，它们与此前描述的 Sicyoidochytrium minutum 的 SmDNAV 关系密切；而 Schizochytrium sp. 20888 则携带两种mirusvirus和一种SmDNAV样核质大DNA病毒。我们还在先前已测序的海生网粘菌基因组中发现了额外的SmDNAV型病毒。系统发育分析表明，SmDNAV及SmDNAV样基因组隶属于核质大DNA病毒门（Nucleocytoviricota）中一个此前未被识别的家族，本文将其命名为“Skiaviridae”。已鉴定的全部10个Skiaviridae基因组大小均为190–250千碱基对（kb），并且缺失了包括B家族DNA聚合酶和DNA依赖的RNA聚合酶在内的多种病毒标志性基因。来自 Schizochytrium sp. 20888 和 Schizochytrium aggregatum 的转录组学和蛋白质组学数据表明，在未出现细胞病变效应的情况下存在skiavirus表达。在 Schizochytrium sp. 20888 细胞中，有一小部分观察到了与mirusvirus和skiavirus预期大小及形态一致的病毒颗粒，这提示这些病毒在实验室培养条件下的复制可能受到限制。系统发育分析显示，mirusvirus、skiavirus及其海生网粘菌宿主之间近期发生了遗传交换。这些发现凸显了多样化大型DNA病毒所致稳定、长期持续性感染的普遍性，并表明共感染为病毒—病毒及病毒—宿主之间的基因转移提供了机会。
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摘要 基因组和宏基因组测序改变了我们对感染真核微生物的大型 DNA 病毒多样性的认识。其中包括新近描述的感染变形虫的 manesvirus，以及与食菌异鞭金藻 Aurantiochytrium limacinum 相关的 mirusvirus。利用长读长测序技术，我们组装了两种食菌异鞭金藻的基因组，并发现了普遍存在的共培养病毒。结果发现， Schizochytrium aggregatum ATCC 28209 含有两种核质大 DNA 病毒，它们与此前描述的感染 Sicyoidochytrium minutum 的 SmDNAV 密切相关；而 Schizochytrium sp. 20888 则携带两种 mirusvirus 和一种 SmDNAV 样核质大 DNA 病毒。我们还在此前已测序的食菌异鞭金藻基因组中发现了额外的 SmDNAV 型病毒。系统发育分析表明，SmDNAV 及 SmDNAV 样基因组属于 Nucleocytoviricota 中一个此前未被识别的科，在此命名为“ Skiaviridae ”。所有 10 个已鉴定的 Skiaviridae 基因组大小均为 190–250 千碱基对（kb），并且缺失多种病毒标志性基因，包括 B 家族 DNA 聚合酶和 DNA 依赖的 RNA 聚合酶。来自 Schizochytrium sp. 20888 和 Schizochytrium aggregatum 的转录组和蛋白质组数据表明，在无细胞病变效应的情况下存在 skiavirus 表达。在 Schizochytrium sp. 20888 的少量细胞中观察到与 mirusvirus 和 skiavirus 预期大小及形态一致的病毒颗粒，这提示这些病毒在实验室培养条件下的复制可能受到限制。系统发育分析显示，mirusvirus、skiavirus 及其食菌异鞭金藻宿主之间近期发生了遗传交换。这些发现强调了多样化大型 DNA 病毒所造成的稳定、长期、持续性感染的普遍性，并表明共感染为病毒—病毒及病毒—宿主之间的基因转移提供了机会。
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发布于 2026 年 7 月 30 日。 下载 PDF 电子邮件
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Jessica Latimer ， Shannon J Sibbald ， Kate Thomson ， Yumi Murakoshi ， Kayla Surgenor ， Dudley Chung ， Nikolaj Brask ， Hongda Zhao ， Craig McCormick ， Hiroyuki Ogata ， Yoshitake Takao ， John M Archibald
bioRxiv 2026.07.28.741200； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.28.741200
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Skiaviridae ：持续感染食菌异鞭金藻原生生物的大型 DNA 病毒科
Jessica Latimer ， Shannon J Sibbald ， Kate Thomson ， Yumi Murakoshi ， Kayla Surgenor ， Dudley Chung ， Nikolaj Brask ， Hongda Zhao ， Craig McCormick ， Hiroyuki Ogata ， Yoshitake Takao ， John M Archibald
bioRxiv 2026.07.28.741200； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.28.741200
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🏷️ 大型DNA病毒 持续感染 海生网粘菌 系统发育分析 宏基因组测序 病毒-宿主基因交换