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从同一患者中连续分离获得的碳青霉烯耐药大肠杆菌（carbapenem-resistant Escherichia coli, CREc）通常保留相同的碳青霉烯酶，而耐药性升级通常归因于外膜孔蛋白缺失与既存β-内酰胺酶表达的共同作用。我们采用全基因组测序对一对克隆性CREc分离株CAEC145和CAEC155进行了特征分析；这两株菌分离自一名住院患者，采集时间相隔25天，对应连续发生的泌尿道感染和血流感染。两者均属于序列型361（ST361）、系统发育群A、血清型O-不可分型:H30，且仅相差28个核心基因组单核苷酸多态性（SNP），证实其具有克隆相关性。尽管如此，这两株分离株在碳青霉烯酶构成方面却存在显著差异。CAEC145在一条可接合的IncFII(pCoo)/ColKP3质粒上携带blaOXA-1207，这是一种近期报道的OXA-48家族变体；而CAEC155缺乏该决定基因，转而在一条保守的IncX3质粒上携带blaNDM-4，该质粒与pJEG027几乎完全相同，后者属于一条全球传播的IncX3谱系。这种基因型转换对应着明确的表型转变。CAEC145对亚胺培南和美罗培南保持敏感，但对厄他培南耐药；而CAEC155则对这三种碳青霉烯类药物以及头孢他啶-阿维巴坦均表现出一致的高水平耐药。然而，两株分离株对亚胺培南-瑞来巴坦、美罗培南-法硼巴坦和头孢地尔均保持敏感。比较基因组学分析表明，blaOXA-1207元件与一种ΔTn6361转座子结构相关，该结构同样存在于最初报道blaOXA-1207的德国原始分离株中；而基于137个基因组构建的核心基因组系统发育树则显示，这两株分离株均位于一个全球传播的、携带多类碳青霉烯酶的ST361谱系之中。据我们所知，这些发现记录了首例在单次连续性大肠杆菌感染过程中、宿主体内由OXA-48样碳青霉烯酶向NDM型碳青霉烯酶演替的现象，其驱动机制并非原位基因进化，而是质粒水平的替代；这一发现对基因组监测和抗菌药物选择具有重要意义。
宿主体内从 OXA-48 样碳青霉烯酶向 NDM 型碳青霉烯酶的演替：从序贯尿路感染和血流感染中分离的克隆性 ST361 大肠杆菌 | bioRxiv
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宿主体内从 OXA-48 样碳青霉烯酶向 NDM 型碳青霉烯酶的演替：从序贯尿路感染和血流感染中分离的克隆性 ST361 大肠杆菌
Leon Kassabian， Charbel Al Khoury， George F Araj， Sima Tokajian
doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.27.741121
Leon Kassabian 1 黎巴嫩黎美大学，黎巴嫩； 在 Google Scholar 上查找该作者 在 PubMed 上查找该作者 在持有人为作者/资助方，其已授予 bioRxiv 永久展示该预印本的许可。 本文依据 CC-BY-NC 4.0 国际许可协议 公开提供。
返回顶部 上一篇 下一篇 发布于 2026 年 7 月 30 日。
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🏷️ 大肠杆菌 碳青霉烯耐药 NDM型碳青霉烯酶 OXA-48样酶 质粒替代 全基因组测序