Gata.a、Tbx21和Klf6/7在海鞘胚胎合子基因组激活中协同发挥作用

在海鞘胚胎中，合子基因组的基因表达始于8细胞期与16细胞期之间。尽管在这些阶段，大多数合子基因在特定细胞谱系中表达，但为建立特异性表达模式提供空间线索的转录因子本身不足以在正常生理水平上激活其靶基因。Gata.a是一种转录因子，可为在动物半球中特异表达的靶基因提供空间线索。值得注意的是，它对于许多在植物半球中表达的合子基因达到生理水平表达同样是必需的。在本研究中，我们发现Tbx21和Klf6/7增强了Gata.a的后一种功能。 为确定受这些因子调控的基因在全局上的范围，我们利用对BrU标记的合子mRNA进行RNA测序，鉴定了早期胚胎中被合子激活的基因。结果显示，约80%的所有合子激活基因受这三种因子的调控。也就是说，Gata.a、Tbx21和Klf6/7共同对于在生理水平上调控靶基因表达是必需的。对于一组特异性的广泛分布因子的这种依赖性，类似于其他动物（包括果蝇和脊椎动物）中触发合子基因组激活（ZGA）的先锋转录因子的特征。参与ZGA的调控因子在不同动物之间存在差异，而我们的结果表明，海鞘在ZGA过程中使用了一组不同的转录因子。

在海鞘胚胎中，来自合子基因组的基因表达始于 8 细胞期与 16 细胞期之间。尽管在这些时期，大多数合子基因在特定细胞谱系中表达，但为建立特定表达模式提供空间线索的转录因子，并不足以在正常生理水平上激活其靶基因。Gata.a 是一种转录因子，可为在动物半球中特异表达的靶基因提供空间线索。耐人寻味的是，它对于许多在植物半球中表达的合子基因实现生理水平表达也是必需的。在本研究中，我们发现 Tbx21 和 Klf6/7 可增强 Gata.a 的后一种功能。为了确定受这些因子调控的基因在全局范围内的程度，我们利用对 BrU 标记的合子 mRNA 进行 RNA 测序，鉴定了早期胚胎中由合子激活的基因。结果显示，约 80% 的所有合子激活基因受这三个因子的调控。也就是说，Gata.a、Tbx21 和 Klf6/7 共同构成了在生理水平上调控靶基因表达所必需的因子组。这种对一组特异且广泛分布因子的需求，类似于其他动物（包括果蝇和脊椎动物）中触发合子基因组激活（ZGA）的先导转录因子。参与 ZGA 的调控因子在不同动物之间存在差异，我们的结果表明，海鞘在 ZGA 过程中使用了一组不同的转录因子。

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🏷️ 海鞘胚胎 合子基因组激活 转录因子 Gata.a Tbx21 Klf6/7