可解释的空间生态动态揭示了儿童白血病中的生态保留逃逸与扩增

空间转录组学使得能够在肿瘤生态系统的原位组织结构中对其进行研究，然而许多计算方法仍主要停留在描述性层面，对于空间组织如何约束或促进疾病持续存在所能提供的洞见有限。在此，我们构建了一个具备治疗感知能力的空间生态学框架，整合生态语境发现、生态机会景观、类 Ornstein-Uhlenbeck（OU）滞留、类 Levy 逃逸以及类分支扩增，以刻画儿童白血病组织。通过使用正常骨髓参考程序和儿童白血病空间转录组切片，我们识别出五种反复出现的候选生态语境，这些语境具有不同的恶性、免疫、基质、血管、炎症及应激相关特征。这些语境在骨髓和髓外样本中形成了空间异质性的生态机会景观。类 OU 汇总量用于量化语境特异性的吸引子位置和生态滞留，而类 Levy 分析则识别出与非连续性生态重塑一致的罕见跨语境位移。类分支扩增将生态丰度、潜在位移、机会、逃逸和逃逸状态比例整合为一个可解释的生态扩张指数。一个独立的治疗相关队列显示，原始状态滞留代理、逃逸和扩增可生成连贯的生态学特征图谱，并在定性上与残留持续存在和复发相关扩张相一致。由于现有空间数据集均为横断面数据，这些量应被解释为组织结构的操作性汇总，而非时间演化过程的直接估计。总体而言，该框架通过为儿童白血病中的生态约束、罕见位移、扩增及治疗相关持续存在提供一种可解释的表征，使空间转录组分析超越了静态组织图谱绘制。

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可解释的空间生态动态揭示儿童白血病中的生态滞留、逃逸与放大

Seung-Hwan Kim

doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.27.741112

Seung-Hwan Kim Fisher College

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发布于 2026 年 7 月 30 日。

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Seung-Hwan Kim bioRxiv 2026.07.27.741112； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.27.741112

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Seung-Hwan Kim bioRxiv 2026.07.27.741112； doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.27.741112

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.27.741112v1?rss=1

🏷️ 空间转录组学 儿童白血病 肿瘤生态学 空间异质性 治疗耐受 可解释计算框架