大西洋蛤蜊的基因组种群结构：隐蔽分类单元与种群连通性

大西洋冲浪蛤（Atlantic surfclam），即 Spisula solidissima solidissima，在北大西洋西部支撑着价值数百万美元的渔获产业，其分布包括大陆架沿线乔治浅滩（Georges Bank）和大西洋中部湾（Mid-Atlantic Bight）种群。专属经济区这一部分海域（距岸3-200海里）内的冲浪蛤种群被作为一个单一管理单元进行管理，但其种群统计学连通性此前从未得到直接检验。本研究分析了在美国捕捞分布范围内采集的548个大西洋冲浪蛤个体的超过8,500个单核苷酸多态性位点（SNP），以推断种群结构、基因组多样性和基因流动模式。 基因组分析纳入了8个采样获得的样本和10个参考样本，它们均属于 Spisula solidissima similis，这是一种在形态上难以区分的名义亚种，此前仅知分布于近岸栖息地。本研究在 S.s. solidissima 中识别出新的、形态上隐蔽的种群结构。其中一个操作分类单元（OTU-A）仅发现于新英格兰南部近岸区域，即科德角（Cape Cod）以南。另一个种群单元 OTU-B 则分布于外海及科德角湾（Cape Cod Bay）。联邦渔场中仅发现 OTU-B 蛤类。 每个 OTU 内部的种群之间均存在基因流动，这为当前渔业管理实践提供了依据。近岸州管辖海域中则存在 OTU 混合种群。研究基于核 SNP 以及非对称性的线粒体 DNA 渗入，对两个 OTU 之间以及两个亚种之间的杂交情况进行了分析。最后，我们证明了一种新型 SNP 标记面板可有效用于鉴别这三个分类单元及其杂交后代。

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大西洋滨蛤的基因组种群结构：隐蔽分类单元与种群连通性

Matthew P. Hare

Hannah Hartung

Yuqing Chen

doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.27.740986

Matthew P. Hare

康奈尔大学

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发布于 2026 年 7 月 29 日。

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Matthew P. Hare

Hannah Hartung

Yuqing Chen

bioRxiv

2026.07.27.740986；

doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.27.740986

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大西洋滨蛤的基因组种群结构：隐蔽分类单元与种群连通性

Matthew P. Hare

Hannah Hartung

Yuqing Chen

bioRxiv

2026.07.27.740986；

doi： https://doi.org/10.64898/2026.07.27.740986

📄 原文链接：https://www.biorxiv.org/content/10.64898/2026.07.27.740986v1?rss=1

🏷️ 种群基因组学 种群结构 基因流动 隐蔽分类单元 SNP标记 渔业管理